xyplot con intervalo de confianza (trazado de caja y wisker) agregado en r
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27-10-2019 - |
Pregunta
Quiero agregar un intervalo de confianza de 99% y 95% en XYPLOT.
Los siguientes son datos:
X <- 1:20
Y <- c(0.5, 1.4, 2.3, 3.4, 4.5,
3.3, 3.0, 2.1, 1.5, 0,
0, 3.4, 4.5, 6.7, 5.3, 2.8,
0.5, 3.4, 3.5, 3.7)
mydata <- data.frame (X, Y)
Quiero identificar el valor máximo de Y y el valor x correspondiente es la posición de mediana en la parcela de caja y bigotes. Siempre que el valor de y disminuya por 1 punto (ya sea izquierdo o derecho) es el intervalo de confianza del 99% (estará dentro del cuadro) y cuando la y disminuya a 2 (tanto a la izquierda como a la derecha), las posiciones correspondientes en x se representarán por el bigote.
Trama deseada:
Explicación.
Valor x correspondiente a Max (y) = 6.7 Valor x correspondiente a la caja izquierda = 6.7 - 1, cuadro derecho = 6.7 - 1 Valor x correspondiente para batir izquierda = 6.7 - 2, bigote a la derecha = 6.7 - 2
Solución
La siguiente trama debería comenzar. Utiliza rectángulos en lugar de una placa BW, y tampoco hace interpolación.
Crea los datos:
library(ggplot2)
dat <- data.frame(
x = 1:20,
y = c(0.5, 1.4, 2.3, 3.4, 4.5, 3.3, 3.0, 2.1, 1.5, 0, 0, 3.4, 4.5, 6.7, 5.3, 2.8, 0.5, 3.4, 3.5, 3.7)
)
Escriba una función que devuelva los 5 puntos deseados:
getRange <- function(x, a=1, b=2){
maxy <- max(x)
xMax <- which.max(x)
x2 <- max(which(x[1:xMax] <= (maxy-a)))
x1 <- max(which(x[1:x2] <= (maxy-b)))
x3 <- xMax + min(which(x[-(1:xMax)] < (maxy+a)))
x4 <- x3 + min(which(x[-(1:x3)] < (maxy+b)))
data.frame(x1=x1, x2=x2, max=xMax, x3=x3, x4=x4)
}
Obtenga los valores de rango y la gráfica:
rr <- getRange(dat$y, 1, 3)
ggplot(dat, aes(x, y)) + geom_line() + geom_point() +
geom_rect(data=rr, aes(xmin=x2, xmax=x3, NULL, NULL),
ymin=-Inf, ymax=Inf, fill="blue", alpha=0.25) +
geom_rect(data=rr, aes(xmin=x1, xmax=x4, NULL, NULL),
ymin=-Inf, ymax=Inf, fill="blue", alpha=0.25)