R: ¿Cómo lattice.qq hago una parcela de paneles múltiples de tratamiento [x] versus control?

Question

Tengo una trama de datos que es similar al siguiente:

str(Data)
'data.frame':   11520 obs. of  29 variables:
 $ groupname  : Factor w/ 8 levels "Control","Treatment1",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
 $ fCycle     : Factor w/ 2 levels "Dark","Light": 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 ...
 $ totdist    : num  0 67.5 89.8 109.1 58.3 ...
 #etc.

I puede hacer una única trama de Tratamiento1 vs control como esto:

qq(groupname~totdist|fCycle, data=Data, 
 subset=(groupname=='Control'|groupname=='Treatment1'))

Se ve así:

Me gustaría hacer de forma automática parcelas similares de Treatment2 vs control ... TreatmentX vs control. Es este el lugar para un bucle o no celosía tienen una mejor manera?

Answer 1

Para hacer esto en un solo panel toma algo de re-organización. En primer lugar, voy a generar un conjunto de datos de muestra con el mismo tipo de estructura que el suyo

library(lattice)
Data <- data.frame(groupname = factor(rep(c('Control',paste('Treatment',1:7,sep='')),each = 100)),
                   fCycle = factor(rep(rep(c('Dark','Light'),each = 50),8)),
                   totdist = sample(unlist(iris),800,replace = TRUE))

A continuación, añadir una variable de distinguir entre el tratamiento y control (es decir "Treatment2" se recodifica como "Treatment", etc.)

Data$groupname2 <- factor(gsub('[1-9]','',as.character(Data$groupname)))

A continuación, reorganizar el conjunto de datos de manera que cada grupo de tratamiento se le da una copia de los datos de control

Data2 <- NULL
for(treat in paste('Treatment',1:7,sep='')){
  Data2 <- rbind(Data2,
                 cbind(rbind(Data[Data$groupname == treat,],Data[Data$groupname == 'Control',]),
                       treat))
}

Finalmente podemos hacer la gráfica deseada

qq(groupname2~totdist|fCycle*treat, data=Data2)

Si desea parcelas separadas para cada tratamiento, a continuación, un bucle sería mejor

pdf('treatVsContQq.pdf')
for(treat in paste('Treatment',1:7,sep='')){
  print(qq(groupname~totdist|fCycle, data=Data,
     subset=(groupname=='Control'|groupname==treat)))
}
dev.off()