Fonction d'intersection avec Rcpp

Question

J'ai du mal à implémenter une fonction avec le Rcpp module utilisant cppFunction.Je dois utiliser quelque chose comme R intersect avec deux types NumericVector et renvoie un autre NumericVector avec le résultat, tout comme dans R.

Ce Le document a été d'une certaine aide mais malheureusement, je suis plutôt un novice en ATM C++.

Comment pourrais-je mettre en œuvre le intersect Fonction R avec cppFunction ?

Merci

Answer 1

Vous voudriez probablement utiliser quelque chose comme le unordered_set implémenter intersect:

Déposer myintersect.cpp:

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;

// Enable C++11 via this plugin (Rcpp 0.10.3 or later)
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]

// [[Rcpp::export]]
NumericVector myintersect(NumericVector x, NumericVector y) {
    std::vector<double> res;
    std::unordered_set<double> s(y.begin(), y.end());
    for (int i=0; i < x.size(); ++i) {
        auto f = s.find(x[i]);
        if (f != s.end()) {
            res.push_back(x[i]);
            s.erase(f);
        }
    }
    return Rcpp::wrap(res);
}

Nous pouvons charger la fonction et vérifier qu'elle fonctionne :

library(Rcpp)
sourceCpp(file="myintersect.cpp")

set.seed(144)
x <- c(-1, -1, sample(seq(1000000), 10000, replace=T))
y <- c(-1, sample(seq(1000000), 10000, replace=T))
all.equal(intersect(x, y), myintersect(x, y))
# [1] TRUE

Cependant, il semble que cette approche soit bien moins efficace que la itersect fonction:

library(microbenchmark)
microbenchmark(intersect(x, y), myintersect(x, y))
# Unit: microseconds
#               expr      min       lq   median        uq      max neval
#    intersect(x, y)  424.167  495.861  501.919  523.7835  989.997   100
#  myintersect(x, y) 1778.609 1798.111 1808.575 1835.1570 2571.426   100