Récupérer les paramètres de la liste à l'aide de Rcpp

Question

Nouveau sur Rcpp, je teste comment récupérer et utiliser une liste imbriquée de R avec une structure connue sans recopier des parties de la liste.Le petit exemple de code (avec code R intégré) semble fonctionner (cout est utilisé pour le débogage).

La liste rL récupérée de R peut être très longue donc je ne souhaite pas réallouer de la mémoire (copier des parties de rL).Le code actuel copie-t-il des parties de rL ?

Meilleur Lars

#include <Rcpp.h>
#include <iostream>
using namespace Rcpp;
using namespace std;

// [[Rcpp::export]]
SEXP testing(const List rL) {
   List L(rL);
   SEXP sL2(L["L2"]);
   List L2(sL2);

   SEXP sStateGrpL2(L2["stateGroups"]);
   List stateGrpL2(sStateGrpL2);
   SEXP sStateAllocL2(L2["stateAlloc"]);   
   CharacterVector stateAllocL2(sStateAllocL2);

   SEXP sActionGrpL2(L2["actionGroups"]);
   List actionGrpL2(sActionGrpL2);
   SEXP sActionAllocL2(L2["actionAlloc"]);
   List actionAllocL2(sActionAllocL2);

   vector<string> stateLabels; 
   vector<string> actionLabels;
   CharacterVector actionNames;

   for(int n2 = 0; n2< as<int>(L2["stages"]); n2++) {
      stateLabels = as< vector<string> >(stateGrpL2[as<string>(stateAllocL2[n2])]);
      int s2Size = stateLabels.size(); 
      SEXP sAllocA(actionAllocL2[n2]);
      List allocA(sAllocA);
      actionNames = as<CharacterVector>(allocA[0]);
      cout << "stage:" << n2 << " sN:" << as<string>(stateAllocL2[n2]) << "\n";
      for (int s2=0; s2<s2Size; ++s2) { 
        cout << " s:" << stateLabels[s2] << " aN:" << actionNames[s2] << "\n";
        actionLabels = as< vector<string> >(actionGrpL2[ as<string>(actionNames[s2]) ]);
        int a2Size = actionLabels.size();
        for (int a2=0; a2<a2Size; ++a2) {
           cout << "    a:" << actionLabels[a2] << "\n";
        }
      }
   }

   return wrap(0);
}


/*** R 
L <- list( L2=list(stages=2, 
                   stateGroups=list(s1Grp=c("a","b","c"),s2Grp=c("d","e")), 
                   stateAlloc = c(rep("s1Grp",1),rep("s2Grp",1)), 
                   actionGroups = list(a1Grp=c("terminate","keep"), a2Grp=c("finish")),
                   actionAlloc = list(list( rep("a1Grp",3) ),
                                       list( c("a1Grp","a2Grp") )
                                       )
                   )
     )
testing(L)
*/

Answer 1

Vous écrivez:

La liste RL peut être très grande, donc je ne veux pas utiliser une nouvelle mémoire (copier des parties de RL).Est-ce la façon de procéder ?

À peu près (pour autant que je sache d'un coup d'œil à votre code).

Tous les échanges avec R utilisent SEXP types où le P signifie pointeur -- ce sont des objets proxy peu profonds qui ne pas être copié.Il utilise/réutilise la mémoire des objets R.

Donc, si vous profilez/profilez la mémoire, cela devrait se comporter de la même manière pour N=10 et N=1e5.Mais la preuve est dans le pudding...

Answer 2

Quelques choses :

• Le test de la boucle n2< as<int>(L2["stages"]) est à la fois difficile à lire et inefficace car il est calculé à chaque itération.Vous devriez certainement le faire une seule fois.

• Tous vos as< vector<string> > Créez des copies profondes et ne profite pas du cache de chaîne du R.Tu ne peux pas utiliser unCharacterVector plutôt ?