Recuperar parâmetros de Lista usando Rcpp

Question

Novo Rcpp estou testando como obter e utilizar uma lista aninhada a partir de R com uma estrutura sem a cópia de partes da lista novamente.O pequeno código de exemplo (com o embedded código R) parece funcionar (cout é usado para depuração).

A lista rL obtidos a partir de R pode ser muito grande, de forma que eu não quero para realocar memória (cópia de peças de rL).Faça o atual código de copiar partes de rL?

Melhor Lars

#include <Rcpp.h>
#include <iostream>
using namespace Rcpp;
using namespace std;

// [[Rcpp::export]]
SEXP testing(const List rL) {
   List L(rL);
   SEXP sL2(L["L2"]);
   List L2(sL2);

   SEXP sStateGrpL2(L2["stateGroups"]);
   List stateGrpL2(sStateGrpL2);
   SEXP sStateAllocL2(L2["stateAlloc"]);   
   CharacterVector stateAllocL2(sStateAllocL2);

   SEXP sActionGrpL2(L2["actionGroups"]);
   List actionGrpL2(sActionGrpL2);
   SEXP sActionAllocL2(L2["actionAlloc"]);
   List actionAllocL2(sActionAllocL2);

   vector<string> stateLabels; 
   vector<string> actionLabels;
   CharacterVector actionNames;

   for(int n2 = 0; n2< as<int>(L2["stages"]); n2++) {
      stateLabels = as< vector<string> >(stateGrpL2[as<string>(stateAllocL2[n2])]);
      int s2Size = stateLabels.size(); 
      SEXP sAllocA(actionAllocL2[n2]);
      List allocA(sAllocA);
      actionNames = as<CharacterVector>(allocA[0]);
      cout << "stage:" << n2 << " sN:" << as<string>(stateAllocL2[n2]) << "\n";
      for (int s2=0; s2<s2Size; ++s2) { 
        cout << " s:" << stateLabels[s2] << " aN:" << actionNames[s2] << "\n";
        actionLabels = as< vector<string> >(actionGrpL2[ as<string>(actionNames[s2]) ]);
        int a2Size = actionLabels.size();
        for (int a2=0; a2<a2Size; ++a2) {
           cout << "    a:" << actionLabels[a2] << "\n";
        }
      }
   }

   return wrap(0);
}


/*** R 
L <- list( L2=list(stages=2, 
                   stateGroups=list(s1Grp=c("a","b","c"),s2Grp=c("d","e")), 
                   stateAlloc = c(rep("s1Grp",1),rep("s2Grp",1)), 
                   actionGroups = list(a1Grp=c("terminate","keep"), a2Grp=c("finish")),
                   actionAlloc = list(list( rep("a1Grp",3) ),
                                       list( c("a1Grp","a2Grp") )
                                       )
                   )
     )
testing(L)
*/

Answer 1

Você escreve:

A lista de rL pode ser muito grande, então eu não quiser usar a nova memória (cópia peças de rL).É este o caminho para fazê-lo?

Muito bonita (tanto quanto eu posso dizer a partir de uma olhada no seu código).

Todos os exchange com R usa SEXP tipos onde o P significa ponteiro -- estes são rasos objetos de proxy que irá não podem ser copiados.Ele usa / reutiliza o R de memória do objeto.

Então, se você profile / memória-perfil isto ele deve se comportar da mesma forma, para N=10 e N=1e5.Mas a prova está no pudim...

Answer 2

Algumas coisas :

• O teste de loop n2< as<int>(L2["stages"]) é tanto difícil de ler e ineficiente como é calculada a cada iteração.Você deve definitivamente fazê-lo apenas uma vez.

• Todos os seus as< vector<string> > criar profundo cópias e não tire vantagem de a R de seqüência de caracteres de cache.Você não pode usar um CharacterVector em vez disso ?