Création d'une liste de contiguïté d'un data.frame

Question

I ai un data.frame avec 2 colonnes: Noeud A, Noeud B. Chaque entrée dans la trame implique un avantage dans un graphe entre le noeud A et B.

Il doit y avoir une belle uniligne pour convertir cette data.frame dans une liste de contiguïté. Tous les conseils?

Answer 1

rapide et sale ...

> edges <- data.frame(nodea=c(1,2,4,2,1), nodeb=c(1,2,3,4,5))

> adjlist <- by(edges, edges$nodea, function(x) x$nodeb)

> for (i in as.character(unique(edges$nodea))) {
+   cat(i, ' -> ', adjlist[[i]], '\n')
+ }

1  ->  1 5
2  ->  2 4
4  ->  3

> adjlist
edges$nodea: 1
[1] 1 5
------------------------------------------------------------
edges$nodea: 2
[1] 2 4
------------------------------------------------------------
edges$nodea: 4
[1] 3

Answer 2

Depuis que vous avez taguée cette igraph , que diriez-vous en utilisant une fonctionnalité intégrée?

> g <- graph.data.frame( edges )
> adjlist <- get.adjedgelist(g)

mise en garde est seulement les sommets sont indexés à zéro, ce qui va changer avec igraph 0,6.

Answer 3

> edges <- data.frame(nodea=c(1,2,4,2,1), nodeb=c(1,2,3,4,5))

> attach(edges)

> tapply(nodeb,nodea,unique)

$`1`
[1] 1 5

$`2`
[1] 2 4

$`4`
[1] 3

Answer 4

comment vous représenter même une liste de contiguïté en R? il a besoin des listes de taille variable pour l'ensemble des noeuds adjacents; alors vous devez utiliser une liste (); mais à quoi bon est-il avoir dans R?

Je peux penser à des tours boiteux avec des fonctions comme sapply mais ils font un balayage linéaire pour chaque nœud. mais en jouant autour pendant 1 minute, voici: une liste de pairlists, où le deuxième élément de chaque paire est la liste de contiguïté. sortie est plus fou que le datstructure est vraiment.

> edgelist=data.frame(A=c(1,1,2,2,2),B=c(1,2,2,3,4))
> library(plyr)
> llply(1:max(edgelist), function(a) list(node=a, adjacents=as.list(edgelist$B[edgelist$A==a])))
[[1]]
[[1]]$node
[1] 1

[[1]]$adjacents
[[1]]$adjacents[[1]]
[1] 1

[[1]]$adjacents[[2]]
[1] 2



[[2]]
[[2]]$node
[1] 2

[[2]]$adjacents
[[2]]$adjacents[[1]]
[1] 2

[[2]]$adjacents[[2]]
[1] 3

[[2]]$adjacents[[3]]
[1] 4



[[3]]
[[3]]$node
[1] 3

[[3]]$adjacents
list()


[[4]]
[[4]]$node
[1] 4

[[4]]$adjacents
list()