bases DICOM pour les données volumétrique

Question

Je l'ai regardé une partie de la norme DICOM et la page de Wikipédia (et tous les sujets DICOM sur SO), mais sans vraiment creuser dans la structure de fichier doc (ugh), je laisse perplexe ce que exactement est stocké à l'intérieur d'un fichier DICOM pour un balayage comprenant des données 3D / 4D / 5D. Je veux seulement un aperçu.

prendre du LET IRM comme un exemple. Le fichier contient DICOM

1. un ensemble des premières images 2D prises sous différents angles
2. un empilement de tranches formant un jeu de données voxel 3D
3. un ensemble complet de données 3D

En d'autres termes, ne comprennent DICOM any post-traitement sur les images brutes capturées par la machine d'imagerie?

En ce qui concerne 4D, on peut supposer qu'il est tout simplement une collection de plusieurs ensembles de données 3D, chaque « cadre » est un ensemble de données distinct?

Answer 1

Le DICOM « standard » a tellement d'options différentes en elle, ainsi que des extensions des fournisseurs, que la plupart des choses sont possibles.

Cela dit, la plupart des ensembles de données 3D DICOM que j'ai rencontrés sont des piles d'images 2D. Pour le post-traitement, il dépend uniquement de la machine d'imagerie.

Si vous êtes à la recherche d'une bibliothèque de DICOM disponible gratuitement, vous pouvez essayer GDCM , je ai été assez content.

Answer 2

Le format original DICOM MR est titulaire d'une seule image 2D. Ce format est encore largement pris en charge, très probablement ce que vous avez. Si ce ce que vous avez, vous aurez envie de rassembler toutes les images d'une série pour construire votre volume.

Une nouvelle, améliorée MR format d'image est capable de stocker un volume entier comme une image multi-images. Dans le cas contraire, c'est votre volume. Je ne me souviens pas si un seul objet amélioré MR doit être la série ou non.

Vous pouvez les différencier en regardant le SOP attribut DICOM UID classe (0008,0016):

 Original MR:  1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4   
 Enhanced MR:  1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4.1

Au-dessus, quand je dit que vous pourriez avoir besoin de recueillir « toutes les images dans une série » pour créer un volume, cela signifie que vous utilisez les images qui partagent la même valeur pour l'attribut série UID d'instance (0020,000E ).

Notes:

• DICOM les puristes préféreront le terme « Information sur l'image objet Définition » au lieu du mot « format » comme je l'ai utilisé.
• puristes objecteront DICOM à dire que SOP classe UID définit le format d'image. Pour vos besoins, il fonctionnera.