Основы DICOM для объемных данных
Вопрос
Я посмотрел на несколько стандартных стандартов DICOM и страницы Википедии (и все темы DICOM на так), но без каких-либо копающих в документе Doc (тьфу), я остался запутанным, что точно хранится внутри файла DICOM для сканирования, содержащего данные 3D / 4D / 5D. Я только хочу обзор.
Давайте сделаем МРТ в качестве примера. Содержится ли файл DICOM
- Набор сырого 2D изображений, сделанных из различных углов
- Стек ломтиков, образующих 3D Voxel DataSet
- полный 3D набор данных
Другими словами, DICOM включает Любые Почтовая обработка на сырых изображениях, захваченных машиной для визуализации?
Что касается 4D, по-видимому, это просто коллекция нескольких 3D наборов данных, каждый «рамка» - это отдельный набор данных?
Решение
DICOM «Standard» имеет так много различных вариантов в нем, наряду с расширениями поставщиков, что большинство вещей возможны.
Тем не менее, большинство 3D наборов данных DICOM, которые я столкнулся, представляют собой 2D изображения. Для постобработки это зависит исключительно на машине изображений.
Если вы ищете свободно доступную библиотеку DICOM, вы можете попробовать GDCM., Я был довольно доволен этим.
Другие советы
Оригинальный формат DICOM MR содержит один, 2D-изображение. Этот формат все еще широко поддерживается, вполне вероятно, что у вас есть. Если это является То, что у вас есть, то вы захотите собрать все изображения в серии, чтобы построить свой том.
Новее, расширенный формат MR Image способен хранить весь громкость в виде многокранного изображения. Если это так, это ваш том. Я не вспоминаю, должен ли один улучшенный г-н объект должен быть весь серию или нет.
Вы можете рассказать им, что смотрите на атрибут DICOM SOP Class UID (0008,0016):
Original MR: 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4
Enhanced MR: 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4.1
Выше, когда я сказал, что вам может потребоваться собрать «все изображения в серии», чтобы построить громкость, это означает, что вы используете изображения, которые разделяют одно и то же значение для экземпляра экземпляра серии атрибутов (0020 000e).
Примечания:
- Purists DICOM предпочтет термин «определение объекта информации о изображении» вместо слова «формата», как я использовал его.
- Пуристы DICOM будут возражать, чтобы сказать, что UID Class SOP определяет формат изображения. Для ваших целей он будет работать.