Domanda

Sto praticando C ++ e ho fatto una classe che memorizza le sequenze lette da formato veloce e dai loro nomi. Il codice è di seguito:

#include<fstream>
#include<iostream>
#include<string>
#include<vector>

using namespace std;

class Sequence {
    vector<string> fullSequence, sequenceNames;

public:
    void fastaRead(string fileName);
    string getSequence(int index);

};

string Sequence::getSequence(int index)
{
    return fullSequence[index];
}


void Sequence::fastaRead(string fileName)
{
    vector<string> fullSequence, sequenceNames;
    ifstream inputFile;
    inputFile.open(fileName);
    if (inputFile.is_open()) {
        string currentSeq;
        string line;
        bool newseq = false;
        while (getline(inputFile, line))
        {
            if (line[0] == '>') {
                sequenceNames.push_back(line.substr(1,line.size()));
                newseq = true;
            } else {
                if (newseq == true) {
                    fullSequence.push_back(currentSeq);
                    currentSeq = line;
                    newseq = false;
                } else {
                    currentSeq.append(line);
                }
            }
        }
    }
    inputFile.close();
}


int main()
{
    Sequence inseq;
    cout << "Fasta Sequence Filepath" << endl;
    string input;
    getline(cin, input);
    inseq.fastaRead(input);
    inseq.getSequence(0);
    return 0;
}

Tuttavia, quando eseguo il programma con il seguente file di input fittizio:

>FirstSeq
AAAAAAAAAAAAAA
BBBBBBBBBBBBBB
>SecondSeq
TTTTTTTTTTTTTT
>ThirdSequence
CCCCCCCCCCCCCC
>FourthSequence
GGGGGGGGGGGGGG

Ottengo un errore di segmentazione quando la linea inset.getSequence(0) è chiamato. Cosa ho fatto che provoca la colpa del Seg e come posso assicurarmi che non accada? So che può avere qualcosa a che fare con gli errori nei suggerimenti, ma non credo di aver usato puntatori che se ricordo correttamente richiede il * carattere *.

Grazie, Ben.

È stato utile?

Soluzione

Devi rimuovere vector<string> fullSequence, sequenceNames; nel vuoto Sequence::fastaRead funzione. Quando si definiscono quelle variabili all'interno di quella funzione e le usi, non si accede a quelle della classe che hanno lo stesso nome, stai accedendo alle variabili locali che hai definito in quella funzione, a meno che non le prendino this-> durante l'accesso.

Le variabili nella classe sono effettivamente vuote e si ottiene un errore di segmentazione.

Autorizzato sotto: CC-BY-SA insieme a attribuzione
Non affiliato a StackOverflow
scroll top