Che tipo di ricerca può essere fatto con i dati genomici?

Question

E 'noto che la scienza ci ha dato grande quantità di dati accessibili in omaggio, come http://www.1000genomes.org e http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank. Come possiamo giocare con i dati e applicare i dati della scienza / apprendimento automatico ad esso? Cosa potrebbe esserci di qualche idea?

Le mie idee:

• Biological visualizzazione dei dati
• previsione Gene utilizzando-Markov-modello nascosto

Non più?

Answer 1

• Determinare la funzione dei geni e gli elementi che regolano geni in tutto il genoma.
• Trova variazioni nella sequenza del DNA tra le persone e determinare la loro significato. Il tipo più comune di variazione genetica è noto come un polimorfismo a singolo nucleotide o SNP (pronunciato “snip”). Questi piccole differenze possono aiutare a predire il rischio di una persona di particolare malattie e risposta a determinati farmaci.
• Scopri le strutture 3-dimensionale di proteine ??e identificare la loro funzioni.
• Scopri come il DNA e le proteine ??interagiscono tra loro e con il ambiente per creare sistemi viventi complessi.
• Sviluppare e applicare strategie di genoma-based per la diagnosi precoce, la diagnosi e il trattamento della malattia.
• Sequenza genomi di altri organismi, come il ratto, mucca, e scimpanzé, al fine di confrontare geni simili tra le specie.
• sviluppare nuove tecnologie per i geni di studio e DNA su larga scala e memorizzare i dati genomici in modo efficiente.
• Continuate ad esplorare le questioni etiche, legali e sociali sollevate dalle ricerca genomica.
• Fonte

Answer 2

E 'possibile costruire modelli per classificare genomi per popolazione. Eseguire apprendimento non supervisionato (clustering) per vedere se le popolazioni sono ricostruiti nel modello. Modelli a costruzione di inferire genotipi mancanti

Per fare un scalabile analisi del DNA è possibile controllare Adam software basato su Apache Spark