Domanda

Recentemente ho visto una persona con una T-shirt con qualche codice Perl sul retro. Ho preso una foto di esso e ritagliato il codice:

alt text

Poi ho cercato di estrarre il codice dall'immagine tramite OCR, così ho installato Tesseract OCR e il pitone binding per esso, pytesser .

Pytesser funziona solo sulle immagini TIFF, così ho trasformato l'immagine in Gimp ed è entrato il seguente codice (Ubuntu 9.10):

>>> from pytesser import *
>>> image = Image.open('code.tif')
>>> print image_to_string(image)
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "pytesser.py", line 30, in image_to_string
    util.image_to_scratch(im, scratch_image_name)
  File "util.py", line 7, in image_to_scratch
    im.save(scratch_image_name, dpi=(200,200))
  File "/usr/lib/python2.6/dist-packages/PIL/Image.py", line 1406, in save
    save_handler(self, fp, filename)
  File "/usr/lib/python2.6/dist-packages/PIL/BmpImagePlugin.py", line 197, in _save
    raise IOError("cannot write mode %s as BMP" % im.mode)
IOError: cannot write mode RGBA as BMP
>>> r,g,b,a = image.split()
>>> img = Image.merge("RGB", (r,g,b))
>>> print image_to_string(img)
Tesseract Open Source OCR Engine

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   § {Jf**$d$ }‘$p•¢L#d¤ Sc}
  »   i `  i A1:

Questo è chiaramente senza senso che esce dal motore OCR. Quindi, la mia domanda è:

  • Che cosa devo fare per ottenere una migliore risultati dell'OCR di Tesseract?
  • In alternativa, qualcuno altro ha più fortuna estrarre il codice dall'immagine qui sopra in un altro modo?
È stato utile?

Soluzione

Probabilmente si può digitare più velocemente di quanto si può ripulire le immagini ed installare motori OCR:

#!/usr/bin/perl
(my$d=q[AA                GTCAGTTCCT
  CGCTATGTA                 ACACACACCA
    TTTGTGAGT                ATGTAACATA
      CTCGCTGGC              TATGTCAGAC
        AGATTGATC          GATCGATAGA
          ATGATAGATC     GAACGAGTGA
            TAGATAGAGT GATAGATAGA
              GAGAGA GATAGAACGA
                TC GATAGAGAGA
                 TAGATAGACA G
               ATCGAGAGAC AGATA
             GAACGACAGA TAGATAGAT
           TGAGTGATAG    ACTGAGAGAT
         AGATAGATTG        ATAGATAGAT
       AGATAGATAG           ACTGATAGAT
     AGAGTGATAG             ATAGAATGAG
   AGATAGACAG               ACAGACAGAT
  AGATAGACAG               AGAGACAGAT
  TGATAGATAG             ATAGATAGAT
  TGATAGATAG           AATGATAGAT
   AGATTGAGTG        ACAGATCGAT
     AGAACCTTTCT   CAGTAACAGT
       CTTTCTCGC TGGCTTGCTT
         TCTAA CAACCTTACT
           G ACTGCCTTTC
           TGAGATAGAT CGA
         TAGATAGATA GACAGAC
       AGATAGATAG  ATAGAATGAC
     AGACAGAGAG      ACAGAATGAT
   CGAGAGACAG          ATAGATAGAT
  AGAATGATAG             ACAGATAGAC
  AGATAGATAG               ACAGACAGAT
  AGACAGACTG                 ATAGATAGAT
   AGATAGATAG                 AATGACAGAT
     CGATTGAATG               ACAGATAGAT
       CGACAGATAG             ATAGACAGAT
         AGAGTGATAG          ATTGATCGAC
           TGATTGATAG      ACTGATTGAT
             AGACAGATAG  AGTGACAGAT
               CGACAGA TAGATAGATA
                 GATA GATAGATAG
                    ATAGACAGA G
                  AGATAGATAG ACA
                GTCGCAAGTTC GCTCACA
])=~s/\s+//g;%a=map{chr $_=>$i++}65,84,67,
71;$p=join$;,keys%a;while($d=~/([$p]{4})/g
){next if$j++%96>=16;$c=0;for$d(0..3){$c+=
$a{substr($1,$d,1)}*(4**$d)}$perl.=chr $c}
             eval $perl;

Modifica:. errore di battitura

Altri suggerimenti

pretrattamento sicuramente produrre un'immagine più lavorabile.

Per esempio, qui è il risultato di Gimp "Livelli", "differenza delle gaussiane" e "Livelli" filtri sull'immagine.

image pre elaborati

A pochi piccoli errori di battitura nel codice RedDwight.

#!/usr/bin/perl
(my $d=q[AA                GTCAGTTCCT
  CGCTATGTA                 ACACACACCA
    TTTGTGAGT                ATGTAACATA
      CTCGCTGGC              TATGTCAGAC
        AGATTGATC          GATCGATAGA
          ATGATAGATC     GAACGAGTGA
            TAGATAGAGT GATAGATAGA
              GAGAGA GATAGAACGA
                TC GATAGAGAGA
                 TAGATAGACA G
               ATCGAGAGAC AGATA
             GAACGACAGA TAGATAGAT
           TGAGTGATAG    ACTGAGAGAT
         AGATAGATTG        ATAGATAGAT
       AGATAGATAG           ACTGATAGAT
     AGAGTGATAG             ATAGAATGAG
   AGATAGACAG               ACAGACAGAT
  AGATAGACAG               AGAGACAGAT
  TGATAGATAG             ATAGATAGAT
  TGATAGATAG           AATGATAGAT
   AGATTGAGTG        ACAGATCGAT
     AGAACCTTTCT   CAGTAACAGT
       CTTTCTCGC TGGCTTGCTT
         TCTAA CAACCTTACT
           G ACTGCCTTTC
           TGAGATAGAT CGA
         TAGATAGATA GACAGAC
       AGATAGATAG  ATAGAATGAC
     AGACAGAGAG      ACAGAATGAT
   CGAGAGACAG          ATAGATAGAT
  AGAATGATAG             ACAGATAGAC
  AGATAGATAG               ACAGACAGAT
  AGACAGACTG                 ATAGATAGAT
   AGATAGATAG                 AATGACAGAT
     CGATTGAATG               ACAGATAGAT
       CGACAGATAG             ATAGACAGAT
         AGAGTGATAG          ATTGATCGAC
           TGATTGATAG      ACTGATTGAT
             AGACAGATAG  AGTGACAGAT
               CGACAGA TAGATAGATA
                 GATA GATAGATAG
                    ATAGACAGA G
                  AGATAGATAG ACA
                GTCGCAAGTTC GCTCACA
])=~s/\s+//g;%a=map{chr $_=>$i++}65,84,67,
71;$p=join$;,keys%a;while($d=~/([$p]{4})/g
){next if$j++%96>=16;$c=0;for$d(0..3){$c+=
$a{substr($1,$d,1)}*(4**$d)}$perl.=chr $c}
             eval $perl;

che quando eseguito produce:

Just another genome hacker.

Se fossi in te mi piacerebbe iniziare pulendo l'immagine il più possibile, utilizzando un programma di foto-manipolazione (GIMP, per esempio) in modo che l'ingresso per l'OCR sarebbe più facilmente comprensibile.

Se possibile, obiettivo per la creazione di una unica immagine in bianco e nero.

Hmm forse avete bisogno di elaborare l'immagine, vale a dire mettere se alcuni filtri come 'il rilevamento dei bordi', rilievo / incidere o un filtro di rumore ...

Le buone OCR sono fortemente guidati da licenziamenti in linguaggi naturali per produrre un sottoinsieme per "quello che potrebbe essere il prossimo carattere". codice Perl non dà tali aiuti per l'OCR. Digitare in mano.

La chiave per un compito come questo è di sfruttare i vincoli evidenti. Trovare una libreria che permette di specificare il proprio set di caratteri. Richiedono tutti i personaggi principali eliche del DNA per essere uno di A T G C. richiedono che il tutto parse come Perl. Digitare le parti dure a mano se necessario.

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