DICOM basi per i dati volumetrici

StackOverflow https://stackoverflow.com/questions/4431520

  •  09-10-2019
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Domanda

ho guardato un po 'dello standard DICOM e la pagina di Wikipedia (e tutti gli argomenti DICOM su SO), ma senza veramente scavare nel doc struttura di file (ugh), io sono rimasto confuso quello che esattamente è memorizzato all'interno di un file DICOM per un composto di scansione 3D / 4D / 5D dati. Voglio solo una panoramica.

introito di Let MRI come esempio. Ha il file DICOM contiene

  1. un insieme delle immagini 2D prime prese da varie angolazioni
  2. una pila di fette che formano un 3D voxel set di dati
  3. un 3D completo set di dati

In altre parole, fa DICOM includono qualsiasi post-processing sulle immagini RAW catturate dalla macchina di imaging?

Per quanto riguarda il 4D, presumibilmente è semplicemente una raccolta di più set di dati 3D, ogni 'frame' è un insieme di dati distinto?

È stato utile?

Soluzione

Il DICOM "standard" ha tante opzioni diverse in esso, insieme con le estensioni del fornitore, che la maggior parte le cose sono possibili.

Detto questo, la maggior parte in 3D DICOM dataset che ho incontrato sono 2D pile di immagini. Per la post-elaborazione, dipende esclusivamente sulla macchina di imaging.

Se siete alla ricerca di una libreria DICOM liberamente disponibile, è possibile provare GDCM , ho 've stato abbastanza soddisfatto.

Altri suggerimenti

Il formato originale DICOM MR detiene una singola immagine, 2D. Questo formato è ancora ampiamente supportato, molto probabilmente quello che hai. Se che è quello che hai, allora ti consigliamo di raccogliere tutte le immagini in una serie per costruire il volume.

A, maggiore formato immagine MR recente è in grado di memorizzare un intero volume come immagine multi-frame. Se lo fa, questo è il volume. Non ricordo se un singolo oggetto MR maggiore deve essere l'intera serie o meno.

Puoi dire loro a parte, cercando in l'attributo DICOM SOP Class UID (0008,0016): 

 Original MR:  1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4   
 Enhanced MR:  1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4.1

In alto, quando ho detto che potrebbe essere necessario per raccogliere "tutte le immagini in una serie" per costruire un volume, che significa che si sta utilizzando le immagini che condividono lo stesso valore per l'attributo Series Instance UID (0020,000E ).

Note:

  • DICOM puristi preferiranno il termine "Immagine Informazione Oggetto Definizione" al posto della parola "format" come ho iniziato ad usare.
  • DICOM puristi obietteranno a dire che SOP Class UID definisce il formato dell'immagine. Per i vostri scopi, funzionerà.
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