data.frameから隣接リストを作成

Question

私は2列のdata.frame有する：ノードA、ノードBのフレーム内の各エントリは、ノードAとB

との間のグラフのエッジを暗示します

隣接リストにこのdata.frameを変換するための素敵なワンライナーがなければなりません。任意のヒント？

Answer 1

クイックと汚い...

> edges <- data.frame(nodea=c(1,2,4,2,1), nodeb=c(1,2,3,4,5))

> adjlist <- by(edges, edges$nodea, function(x) x$nodeb)

> for (i in as.character(unique(edges$nodea))) {
+   cat(i, ' -> ', adjlist[[i]], '\n')
+ }

1  ->  1 5
2  ->  2 4
4  ->  3

> adjlist
edges$nodea: 1
[1] 1 5
------------------------------------------------------------
edges$nodea: 2
[1] 2 4
------------------------------------------------------------
edges$nodea: 4
[1] 3

Answer 2

あなたがこの IGRAPH のタグ付けtitle="show、方法について機能が組み込まれて使用しているか？

> g <- graph.data.frame( edges )
> adjlist <- get.adjedgelist(g)

唯一の注意点は、頂点がゼロIGRAPH 0.6で変更される、索引付けされている。

Answer 3

> edges <- data.frame(nodea=c(1,2,4,2,1), nodeb=c(1,2,3,4,5))

> attach(edges)

> tapply(nodeb,nodea,unique)

$`1`
[1] 1 5

$`2`
[1] 2 4

$`4`
[1] 3

Answer 4

どのようにあなたもRで隣接リストを表しているのでしょうか？隣接するノードのセットのための可変サイズのリストが必要。そう、あなたは（）のリストを使用する必要があります。しかし、その後、何が良いそれがRでそれを持っている？

私はsapplyのような機能を備えたラメトリックを考えることができますが、彼らはすべてのノードに対してリニアスキャンを行います。しかし、1分間遊んで、ここにある：各ペアの2番目の項目は、隣接リストであるpairlistsのリスト、。出力はdatstructureが実際よりスゴされます。

> edgelist=data.frame(A=c(1,1,2,2,2),B=c(1,2,2,3,4))
> library(plyr)
> llply(1:max(edgelist), function(a) list(node=a, adjacents=as.list(edgelist$B[edgelist$A==a])))
[[1]]
[[1]]$node
[1] 1

[[1]]$adjacents
[[1]]$adjacents[[1]]
[1] 1

[[1]]$adjacents[[2]]
[1] 2



[[2]]
[[2]]$node
[1] 2

[[2]]$adjacents
[[2]]$adjacents[[1]]
[1] 2

[[2]]$adjacents[[2]]
[1] 3

[[2]]$adjacents[[3]]
[1] 4



[[3]]
[[3]]$node
[1] 3

[[3]]$adjacents
list()


[[4]]
[[4]]$node
[1] 4

[[4]]$adjacents
list()