R:lattice.qq治療のマルチパネルプロット[x] vsコントロールを行うにはどうすればよいですか?

StackOverflow https://stackoverflow.com/questions/3120468

  •  30-09-2019
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質問

私は次のようなデータフレームを持っています:

str(Data)
'data.frame':   11520 obs. of  29 variables:
 $ groupname  : Factor w/ 8 levels "Control","Treatment1",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
 $ fCycle     : Factor w/ 2 levels "Dark","Light": 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 ...
 $ totdist    : num  0 67.5 89.8 109.1 58.3 ...
 #etc.

このようなTreatment1対制御の単一のプロットを行うことができます:

qq(groupname~totdist|fCycle, data=Data, 
 subset=(groupname=='Control'|groupname=='Treatment1'))

このように見えます:

alt text

Treatment2対Control ... TreatmentX対Controlの同様のプロットを自動的に作成したいと思います。これはループの場所ですか、それとも格子はより良い方法を持っていますか?

役に立ちましたか?

解決

これを1つのパネルで行うには、再配置が必要です。まず、あなたと同じ種類の構造を持つサンプルデータセットを生成します

library(lattice)
Data <- data.frame(groupname = factor(rep(c('Control',paste('Treatment',1:7,sep='')),each = 100)),
                   fCycle = factor(rep(rep(c('Dark','Light'),each = 50),8)),
                   totdist = sample(unlist(iris),800,replace = TRUE))

次に、変数を追加して治療とコントロールを区別します(つまり、 "Treatment2" Asとして再確認されます "Treatment", 、など)

Data$groupname2 <- factor(gsub('[1-9]','',as.character(Data$groupname)))

次に、各治療グループにコントロールデータのコピーが与えられるように、データセットを再配置します

Data2 <- NULL
for(treat in paste('Treatment',1:7,sep='')){
  Data2 <- rbind(Data2,
                 cbind(rbind(Data[Data$groupname == treat,],Data[Data$groupname == 'Control',]),
                       treat))
}

最後に、目的のグラフを作成できます

qq(groupname2~totdist|fCycle*treat, data=Data2)

治療ごとに個別のプロットが必要な場合は、ループの方が良いでしょう

pdf('treatVsContQq.pdf')
for(treat in paste('Treatment',1:7,sep='')){
  print(qq(groupname~totdist|fCycle, data=Data,
     subset=(groupname=='Control'|groupname==treat)))
}
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