Recomendação de gráficos multivariados para R

Question

Você poderia, por favor, recomendar a melhor maneira de visualizar dados com quatro variáveis em qualquer um dos pacotes R disponíveis.

Ou seja, tenho duas variáveis categóricas (populações (12) e caracteres (50)) e duas variáveis contínuas (média e coeficiente de variação de cada medição de comprimento de caracteres para 100 indivíduos (linhas em uma matriz)).Portanto, é basicamente um gráfico dimensional 12x50x100x100.

Alguma sugestão?

Answer 1

Eu plotaria as variáveis primeiro uma a uma, depois juntas, começando com toda a população e progressivamente dividir os dados em vários grupos.

# Sample data
n1 <- 6   # Was: 12
n2 <- 5   # Was: 50
n3 <- 10  # Was: 100
d1 <- data.frame(
  population = rep(LETTERS[1:n1], each=n2*n3),
  character = rep(1:n2, each=n3, times=12),
  id = 1:(n1*n2*n3),
  mean = rnorm(n1*n2*n3),
  var  = rchisq(n1*n2*n3, df=5)
)
# Not used, but often useful with ggplot2
library(reshape2)
d2 <- melt(d1, id.vars=c("population","character","id"))

# Look at the first variable
library(lattice)
densityplot( ~ mean, data=d1 )
densityplot( ~ mean, groups=population, data=d1 )
densityplot( ~ mean | population, groups=character, data=d1 )

# Look at the second variable
densityplot( ~ var, data=d1 )
densityplot( ~ var, groups=population, data=d1 )
densityplot( ~ var | population, groups=character, data=d1 )

# Look at both variables
xyplot( mean ~ var, data=d1 )
xyplot( mean ~ var, groups=population, data=d1 )
xyplot( mean ~ var | population, groups=character, data=d1 )

# The plots may be more readable with lines rather than points
xyplot( 
  mean ~ var | population, groups = character, 
  data = d1, 
  panel = panel.superpose, panel.groups = panel.loess
)

Answer 2

Considere lattice se quiser plotar uma série de "fatias" ao longo de uma dimensão ou outra de seus dados. Por que não dar uma olhada em http://addictedtor.free.fr/graphiques/ e ver se alguémescreveu algum código para criar o tipo de gráfico que você deseja?