Criar uma lista de adjacência de um data.frame

Question

I têm um data.frame com 2 colunas: o nó A, o nó B. Cada entrada no quadro implica uma vantagem em um gráfico de entre o nó A e B.

Deve haver um bom one-liner para converter este data.frame em uma lista de adjacência. Alguma dica?

Answer 1

rápida e suja ...

> edges <- data.frame(nodea=c(1,2,4,2,1), nodeb=c(1,2,3,4,5))

> adjlist <- by(edges, edges$nodea, function(x) x$nodeb)

> for (i in as.character(unique(edges$nodea))) {
+   cat(i, ' -> ', adjlist[[i]], '\n')
+ }

1  ->  1 5
2  ->  2 4
4  ->  3

> adjlist
edges$nodea: 1
[1] 1 5
------------------------------------------------------------
edges$nodea: 2
[1] 2 4
------------------------------------------------------------
edges$nodea: 4
[1] 3

Answer 2

Uma vez que você marcou este IGRAPH , como sobre usando construído em termos de funcionalidade?

> g <- graph.data.frame( edges )
> adjlist <- get.adjedgelist(g)

Apenas ressalva é os vértices são zero indexados, o que vai mudar com IGRAPH 0.6.

Answer 3

> edges <- data.frame(nodea=c(1,2,4,2,1), nodeb=c(1,2,3,4,5))

> attach(edges)

> tapply(nodeb,nodea,unique)

$`1`
[1] 1 5

$`2`
[1] 2 4

$`4`
[1] 3

Answer 4

Como você sequer representam uma lista de adjacência em R? ele precisa de listas de tamanho variável para o conjunto de nodos adjacentes; sim, então você tem que usar uma lista (); mas então o que é bom tê-lo em R?

i pode pensar em truques coxos com sapply-like funções, mas eles fazem uma varredura linear para cada nó. mas jogando em torno de 1 minuto, aqui é: uma lista de pairlists, onde o segundo item de cada par é a lista de adjacência. saída é mais louco do que o datstructure realmente é.

> edgelist=data.frame(A=c(1,1,2,2,2),B=c(1,2,2,3,4))
> library(plyr)
> llply(1:max(edgelist), function(a) list(node=a, adjacents=as.list(edgelist$B[edgelist$A==a])))
[[1]]
[[1]]$node
[1] 1

[[1]]$adjacents
[[1]]$adjacents[[1]]
[1] 1

[[1]]$adjacents[[2]]
[1] 2



[[2]]
[[2]]$node
[1] 2

[[2]]$adjacents
[[2]]$adjacents[[1]]
[1] 2

[[2]]$adjacents[[2]]
[1] 3

[[2]]$adjacents[[3]]
[1] 4



[[3]]
[[3]]$node
[1] 3

[[3]]$adjacents
list()


[[4]]
[[4]]$node
[1] 4

[[4]]$adjacents
list()