Stacked Area Histograma no R

Question

Eu corri um trabalho porco em um cluster Hadoop que mastigou um monte de dados para baixo em algo R pode manipular para fazer uma análise de coorte. Eu tenho o seguinte script e, como da segunda à última linha eu tenho os dados no formato:

> names(data)
[1] "VisitWeek" "ThingAge"    "MyMetric"

VisitWeek é uma data. ThingAge e MyMetric são inteiros.

Os olhares de dados como:

2010-02-07     49  12345

O script eu tenho até agora é:

# Load ggplot2 for charting 
library(ggplot2);

# Our file has headers - column names
data = read.table('weekly_cohorts.tsv',header=TRUE,sep="\t");

# Print the names
names(data)

# Convert to dates
data$VisitWeek = as.Date(data$VisitWeek)
data$ThingCreation = as.Date(data$ThingCreation)

# Fill in the age column
data$ThingAge = as.integer(data$VisitWeek - data$ThingCreation)

# Filter data to thing ages lt 10 weeks (70 days) + a sanity check for gt 0, and drop the creation week column
data = subset(data, data$ThingAge <= 70, c("VisitWeek","ThingAge","MyMetric"))
data = subset(data, data$ThingAge >= 0)

print(ggplot(data, aes(x=VisitWeek, y=MyMetric, fill=ThingAge)) + geom_area())

Esta última linha não funciona. Eu tentei muitas variações, bares, histogramas, mas como docs R habituais me derrotar.

Eu quero isso para mostrar um estilo Excel empilhadas gráfico de área padrão - uma série de tempo para cada ThingAge empilhadas através das semanas no eixo x, com a data no eixo y. Um exemplo deste tipo de gráfico é aqui: http: // upload. wikimedia.org/wikipedia/commons/a/a1/Mk_Zuwanderer.png

Eu li os docs aqui: http://had.co.nz/ggplot2 /geom_area.html e http://had.co.nz/ggplot2/geom_histogram .html e este blog http://chartsgraphs.wordpress.com/2008/10/05/r-lattice-plot-beats-excel-stacked-area-trend-chart/ mas não posso bastante fazer o trabalho para mim.

Como posso conseguir isso?

Answer 1

library(ggplot2)
set.seed(134)
df <- data.frame(
    VisitWeek = rep(as.Date(seq(Sys.time(),length.out=5, by="1 day")),3),
    ThingAge = rep(1:3, each=5),
    MyMetric = sample(100, 15))

ggplot(df, aes(x=VisitWeek, y=MyMetric)) + 
    geom_area(aes(fill=factor(ThingAge)))

me dá a imagem abaixo. Eu suspeito que suas mentiras problema em especificar corretamente o mapeamento de preenchimento para a trama área: fill=factor(ThingAge)

Answer 2

ggplot (data.set, aes (x = tempo, y = Valor, color = Type)) + geom_area (AES (preenchimento = Tipo), posição = 'pilha')

você precisa dar o geom_area um elemento de preenchimento e também empilhá-la (embora isso pode ser um padrão)

http: //www.mail -archive.com/r-help@r-project.org/msg84857.html

Answer 3

Eu era capaz de conseguir o meu resultado com este:

I carregado a função stackedPlot () https: / /stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2005-August/077475.html

A função (não a minha, ver link) foi:

stackedPlot = function(data, time=NULL, col=1:length(data), ...) {

  if (is.null(time))
    time = 1:length(data[[1]]);

  plot(0,0
       , xlim = range(time)
       , ylim = c(0,max(rowSums(data)))
       , t="n" 
       , ...
       );

  for (i in length(data):1) {

    # Die Summe bis zu aktuellen Spalte
    prep.data = rowSums(data[1:i]);

    # Das Polygon muss seinen ersten und letzten Punkt auf der Nulllinie haben
    prep.y = c(0
                , prep.data
                , 0
                )

    prep.x = c(time[1]
                , time
                , time[length(time)]
                )

    polygon(prep.x, prep.y
            , col=col[i]
            , border = NA
            );
  }
}

Então eu reformulado meus dados para o formato de largura. Em seguida, ele trabalhou!

wide = reshape(data, idvar="ThingAge", timevar="VisitWeek", direction="wide");
stackedPlot(wide);

Answer 4

Virando inteiros em fatores e usando geom_bar em vez de geom_area trabalhou para mim:

df<-expand.grid(x=1:10,y=1:6)
df<-cbind(df,val=runif(60))
df$fx<-factor(df$x)
df$fy<-factor(df$y)
qplot(fy,val,fill=fx,data=df,geom='bar')