Como imprimir a matriz Numpy completa, sem truncamento?

Question

Quando imprimir uma matriz Numpy, recebo uma representação truncada, mas quero a matriz completa.

Há alguma maneira de fazer isso?

Exemplos:

>>> numpy.arange(10000)
array([   0,    1,    2, ..., 9997, 9998, 9999])

>>> numpy.arange(10000).reshape(250,40)
array([[   0,    1,    2, ...,   37,   38,   39],
       [  40,   41,   42, ...,   77,   78,   79],
       [  80,   81,   82, ...,  117,  118,  119],
       ..., 
       [9880, 9881, 9882, ..., 9917, 9918, 9919],
       [9920, 9921, 9922, ..., 9957, 9958, 9959],
       [9960, 9961, 9962, ..., 9997, 9998, 9999]])

Answer 1

Usar numpy.set_printoptions:

import sys
import numpy
numpy.set_printoptions(threshold=sys.maxsize)

Answer 2

import numpy as np
np.set_printoptions(threshold=np.inf)

Eu sugiro usar np.inf ao invés de np.nan o que é sugerido por outros. Ambos trabalham para o seu propósito, mas, ao definir o limite para o "infinito", é óbvio para todos que leem seu código o que você quer dizer. Ter um limiar de "não um número" parece um pouco vago para mim.

Answer 3

As respostas anteriores são as corretas, mas como uma alternativa mais fraca, você pode se transformar em uma lista:

>>> numpy.arange(100).reshape(25,4).tolist()

[[0, 1, 2, 3], [4, 5, 6, 7], [8, 9, 10, 11], [12, 13, 14, 15], [16, 17, 18, 19], [20, 21,
22, 23], [24, 25, 26, 27], [28, 29, 30, 31], [32, 33, 34, 35], [36, 37, 38, 39], [40, 41,
42, 43], [44, 45, 46, 47], [48, 49, 50, 51], [52, 53, 54, 55], [56, 57, 58, 59], [60, 61,
62, 63], [64, 65, 66, 67], [68, 69, 70, 71], [72, 73, 74, 75], [76, 77, 78, 79], [80, 81,
82, 83], [84, 85, 86, 87], [88, 89, 90, 91], [92, 93, 94, 95], [96, 97, 98, 99]]

Answer 4

Parece que você está usando Numpy.

Se for esse o caso, você pode adicionar:

import numpy as np
np.set_printoptions(threshold=np.nan)

Isso desativará a impressão de canto. Para mais informações, veja isso Tutorial Numpy.

Answer 5

Aqui está uma maneira única de fazer isso, o que é útil se você não quiser alterar suas configurações padrão:

def fullprint(*args, **kwargs):
  from pprint import pprint
  import numpy
  opt = numpy.get_printoptions()
  numpy.set_printoptions(threshold='nan')
  pprint(*args, **kwargs)
  numpy.set_printoptions(**opt)

Answer 6

Usando um gerente de contexto como Paul Price sugerido

import numpy as np


class fullprint:
    'context manager for printing full numpy arrays'

    def __init__(self, **kwargs):
        kwargs.setdefault('threshold', np.inf)
        self.opt = kwargs

    def __enter__(self):
        self._opt = np.get_printoptions()
        np.set_printoptions(**self.opt)

    def __exit__(self, type, value, traceback):
        np.set_printoptions(**self._opt)

a = np.arange(1001)

with fullprint():
    print(a)

print(a)

with fullprint(threshold=None, edgeitems=10):
    print(a)

Answer 7

Numpy 1.15 ou mais recente

Se você usar o Numpy 1.15 (lançado 2018-07-23) ou mais recente, poderá usar o printoptions Gerente de contexto:

with numpy.printoptions(threshold=numpy.inf):
    print(arr)

(Claro, substitua numpy por np Se é assim que você importou numpy)

O uso de um gerente de contexto (o with-Block) garante que, após o término do gerenciador de contexto, as opções de impressão revertem para o que fossem antes do início do bloco. Ele garante que a configuração seja temporária e aplicada apenas ao código dentro do bloco.

Ver numpy.printoptions documentação Para detalhes sobre o gerenciador de contexto e quais outros argumentos ele suporta.

Answer 8

numpy.savetxt

numpy.savetxt(sys.stdout, numpy.arange(10000))

ou se você precisar de uma string:

import StringIO
sio = StringIO.StringIO()
numpy.savetxt(sio, numpy.arange(10000))
s = sio.getvalue()
print s

O formato de saída padrão é:

0.000000000000000000e+00
1.000000000000000000e+00
2.000000000000000000e+00
3.000000000000000000e+00
...

e pode ser configurado com outros argumentos.

Observe em particular como isso também não mostra os colchetes e permite muita personalização, conforme mencionado em: Como imprimir uma matriz Numpy sem colchetes?

Testado no Python 2.7.12, Numpy 1.11.1.

Answer 9

Esta é uma pequena modificação (removida a opção de transmitir argumentos adicionais para set_printoptions)do Neoks resposta.

Mostra como você pode usar contextlib.contextmanager Para criar facilmente esse manager de contexto com menos linhas de código:

import numpy as np
from contextlib import contextmanager

@contextmanager
def show_complete_array():
    oldoptions = np.get_printoptions()
    np.set_printoptions(threshold=np.inf)
    try:
        yield
    finally:
        np.set_printoptions(**oldoptions)

No seu código, ele pode ser usado assim:

a = np.arange(1001)

print(a)      # shows the truncated array

with show_complete_array():
    print(a)  # shows the complete array

print(a)      # shows the truncated array (again)

Answer 10

Complementar a isso responda do número máximo de colunas (corrigido com numpy.set_printoptions(threshold=numpy.nan)), há também um limite de caracteres a serem exibidos. Em alguns ambientes, como chamando Python da Bash (em vez da sessão interativa), isso pode ser corrigido definindo o parâmetro linewidth como segue.

import numpy as np
np.set_printoptions(linewidth=2000)    # default = 75
Mat = np.arange(20000,20150).reshape(2,75)    # 150 elements (75 columns)
print(Mat)

Nesse caso, sua janela deve limitar o número de caracteres para envolver a linha.

Para aqueles que estão por aí usando texto sublime e querendo ver os resultados na janela de saída, você deve adicionar a opção de compilação "word_wrap": false para o arquivo sublime-build [fonte] .

Answer 11

Para desligá -lo e retornar ao modo normal

np.set_printoptions(threshold=False)

Answer 12

Suponha que você tenha uma matriz numpy

 arr = numpy.arange(10000).reshape(250,40)

Se você deseja imprimir a matriz completa de uma maneira única (sem alternar o np.set_printoptions), mas quer algo mais simples (menos código) do que o gerenciador de contexto, basta fazer

for row in arr:
     print row 

Answer 13

Você pode usar o array2string função - documentos.

a = numpy.arange(10000).reshape(250,40)
print(numpy.array2string(a, threshold=numpy.nan, max_line_width=numpy.nan))
# [Big output]

Answer 14

Desde o Numpy versão 1.16, para mais detalhes, consulte Bilhete do GitHub 12251.

from sys import maxsize
from numpy import set_printoptions

set_printoptions(threshold=maxsize)

Answer 15

Você nem sempre deseja que todos os itens impressos, especialmente para grandes matrizes.

Uma maneira simples de mostrar mais itens:

In [349]: ar
Out[349]: array([1, 1, 1, ..., 0, 0, 0])

In [350]: ar[:100]
Out[350]:
array([1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 1,
       1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
       0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0,
       0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1,
       0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1])

Funciona bem quando matou a matriz <1000 por padrão.

Answer 16

Se uma matriz for muito grande para ser impressa, Numpy pula automaticamente a parte central da matriz e imprime apenas os cantos: para desativar esse comportamento e forçar o Numpy a imprimir toda a matriz, você pode alterar as opções de impressão usando set_printoptions.

>>> np.set_printoptions(threshold='nan')

ou

>>> np.set_printoptions(edgeitems=3,infstr='inf',
... linewidth=75, nanstr='nan', precision=8,
... suppress=False, threshold=1000, formatter=None)

Você também pode se referir ao Documentação Numpy documentação numpy para "ou parte" Para mais ajuda.