Вопрос

Я практикую C ++ и сделал класс, который хранит последовательности, читаемые из Fast Format, а также их имена. Код ниже:

#include<fstream>
#include<iostream>
#include<string>
#include<vector>

using namespace std;

class Sequence {
    vector<string> fullSequence, sequenceNames;

public:
    void fastaRead(string fileName);
    string getSequence(int index);

};

string Sequence::getSequence(int index)
{
    return fullSequence[index];
}


void Sequence::fastaRead(string fileName)
{
    vector<string> fullSequence, sequenceNames;
    ifstream inputFile;
    inputFile.open(fileName);
    if (inputFile.is_open()) {
        string currentSeq;
        string line;
        bool newseq = false;
        while (getline(inputFile, line))
        {
            if (line[0] == '>') {
                sequenceNames.push_back(line.substr(1,line.size()));
                newseq = true;
            } else {
                if (newseq == true) {
                    fullSequence.push_back(currentSeq);
                    currentSeq = line;
                    newseq = false;
                } else {
                    currentSeq.append(line);
                }
            }
        }
    }
    inputFile.close();
}


int main()
{
    Sequence inseq;
    cout << "Fasta Sequence Filepath" << endl;
    string input;
    getline(cin, input);
    inseq.fastaRead(input);
    inseq.getSequence(0);
    return 0;
}

Однако, когда я запускаю программу со следующим фиктивным входным файлом:

>FirstSeq
AAAAAAAAAAAAAA
BBBBBBBBBBBBBB
>SecondSeq
TTTTTTTTTTTTTT
>ThirdSequence
CCCCCCCCCCCCCC
>FourthSequence
GGGGGGGGGGGGGG

Я получаю ошибку сегментации, когда строка inset.getSequence(0) называется. Что я сделал, что вызывает ошибку SEG и как мне убедиться, что этого не произойдет? Я знаю, что это может иметь какое -то отношение к ошибкам в указателях, но я не думаю, что я использовал указатели, которые, если я правильно помню, требует характера *.

Спасибо, Бен.

Это было полезно?

Решение

Вам нужно удалить vector<string> fullSequence, sequenceNames; в пустоте Sequence::fastaRead функция Когда вы определяете эти переменные внутри этой функции и используете их, вы не получаете доступа к тем, которые в классе имеют одинаковое имя, вы получаете доступ к локальным переменным, которые вы определили в этой функции, если только вы не придаете их с this-> во время доступа.

Переменные в классе на самом деле пусты, и вы получаете ошибку сегментации.

Лицензировано под: CC-BY-SA с атрибуция
Не связан с StackOverflow
scroll top