Используя R, чтобы открыть файлы GRIB

Question

Я использую R для работы с метеорологическими данными. Я продолжаю два шага:

1. Конвертировать GRIB на NetCDF с помощью функции командной строки NCL_CONVERT2NC из языка команд NCAR
2. Используйте пакет NCDF в R, чтобы импортировать данные NetCDF.

У меня все еще есть одна проблема:

2- Для некоторых конкретных файлов GRIB преобразование с инструментом NCAR не работает. Есть ли другие способы или трюк (кроме транскрипции в NetCDF) для Прочитайте файлы GRIB в R ?

Проблема, отвечающая Дирком: 1- Я хотел бы сделать автоматическую обработку многих файлов в R. Могу ли я позвонить NCL_Convert2nc внутри R? (Ответил Дирк Эдделбуетель ниже)

Answer 1

Что касается вопроса 1, ответ «да» - см. help(system) и то internal=TRUE Вариант Если вы хотите захватить результаты.

Answer 2

RGDal также может это сделать, но менее гибко и требует большего ухода и детализации, чем NCDF или RNETCDF - и зависит от вашего GDAL / RGDAL, включая водитель GRIB.

Answer 3

ncl_convert2nc, кажется, лучшее решение. Однако, если структура данных немного более сложнее, я использую GRADS для преобразования файла GRIB в ASCII (например, .CSV), а затем можно создать файл NetCDF с использованием пакета NCDF4, предназначенный для R. GALDS, также обеспечивает поддержку Написание GRIB на NetCDF, но есть ограничение только 1 переменной.

Answer 4

Другое решение - использовать программное обеспечение WGRIB / WGRIB2 (http://www.cpc.ncep.noaa.gov/products/wesley/wgrib2/) И сбросьте файл GRIB-1 / GRIB-2 непосредственно в формат CSV, например:

/path/to/your/wgrib2 input_file.grb -csv output_file.csv

Тогда это может быть прочитано непосредственно в R ...

Answer 5

Еще одним быстрым и простым решением командной строки является использование CDO для преобразования:

cdo -f nc copy file.grb file.nc

Если вы хотите вывести файл NetCDF4, который вы указываете «-F NC4».