Puede considerar bibliotecas de software comercial, como la de A2IA Corporation (http://www.a2ia.com/en/a2ia-checkreader-0), o la biblioteca de código abierto Tesseract (http://code.google.com/p/tesseract-ocr/) para operaciones OCR básicas.
Suponiendo que desea leer los caracteres Mic (reconocimiento de caracteres de tinta magnética) en la parte inferior del cheque, A2IA es un buen comienzo, ya que no estoy seguro de si Tesseract funcionará bien con la fuente E13B utilizada para esto.