Potresti prendere in considerazione le biblioteche di software commerciali, come quella di A2IA Corporation (http://www.a2ia.com/en/a2ia-checkreader-0) o la libreria di Tesseract open source (http://code.google.com/p/tesseract-ocr/) per le operazioni di base OCR.
Supponendo che tu voglia leggere i caratteri Mic (Magnetic Ink Recognition) nella parte inferiore del controllo, A2IA è un buon inizio, poiché non sono sicuro se Tesseract funzionerà bene con il carattere E13B usato per questo.