Coefficiente di consanguineità / wrights algoritmo / genetica

Question

Sto cercando un buon codice pseudo - o, meglio ancora frammenti di codice effettivi - per l'attuazione algoritmo wrights su una banca dati genealogica che ho per le pecore memorizzato nel database di SQL Server

.

Ho un vecchio programma C che ha funzionato contro un file di testo piatta fino a quando la popolazione ha ottenuto così grande l'algoritmo ha rotto - come l'intera cosa è stata fatta in memoria, in modo da un'implementazione con un database sarebbe preferibile ...

Chiunque visto nulla di simile che mi può puntare a?

Answer 1

Se non si desidera ripristinare il proprio, è possibile utilizzare il Python pypedal pacchetto per calcolando il coefficiente di inbreeding , che supporta i database SQL .

Codice di Pypedal per il calcolo coefficiente di consanguineità è qui .