근친 교배 / Wrights 알고리즘 / 유전학 계수

Question

SQL Server 데이터베이스에 저장된 양에 대한 계보 데이터베이스에서 Wrights 알고리즘을 구현할 때 좋은 의사 코드 또는 더 나은 실제 코드 스 니펫을 찾고 있습니다.

인구가 너무 커질 때까지 평평한 텍스트 파일에 대해 작동하는 매우 오래된 C 프로그램이 있습니다. 모든 작업이 메모리에서 수행되었으므로 데이터베이스에 대한 구현이 바람직합니다 ...

그들이 나를 지적 할 수있는 이런 것을 본 사람이 있습니까?

Answer 1

직접 굴려면 파이썬을 사용할 수 있습니다. pypedal 패키지 ~을 위한 근친 교배 계수 계산, 어느 SQL 데이터베이스를 지원합니다.

근친 교배 계수를 컴퓨팅하기위한 Pypedal의 코드입니다 여기.