Коэффициент инбридинга/алгоритм Райта/генетика

Question

Я ищу хороший псевдокод - или, еще лучше, фактические фрагменты кода - для реализации алгоритма Райта в базе данных генеалогии овец, хранящейся в базе данных SQL Server.

У меня есть очень старая программа на C, которая работала с плоским текстовым файлом до тех пор, пока популяция не стала настолько большой, что алгоритм сломался - поскольку все это делалось в памяти, поэтому реализация для базы данных была бы предпочтительнее...

Кто-нибудь видел что-нибудь подобное и может мне указать?

Answer 1

Если вы не хотите создавать свои собственные, вы можете использовать Python пакет пипедала для расчет коэффициента инбридинга, который поддерживает базы данных SQL.

Код Пайпедала для вычисления коэффициента инбридинга: здесь.