パッケージにS4関数のソースコードを表示するにはどうすればよいですか?
質問
RのパッケージTopgoを使用して、次のコードで遺伝子濃縮を分析しました。
sampleGOdata <- new("topGOdata", description = "Simple session", ontology = "BP",
allGenes = geneList, geneSel = topDiffGenes, nodeSize = 10,
annot = annFUN.db, affyLib = affyLib)
resultFisher <- runTest(sampleGOdata, algorithm = "classic", statistic = "fisher")
allRes <- GenTable(sampleGOdata, classicFisher = resultFisher, orderBy = "fisher",
ranksOf = "classicFisher",topNodes = 10)
見て変更したいです RunTest
関数と GenTable
変更する機能 ResultTable
, 、しかし、私は関数を表示する方法がわかりません。とともに getAnywhere("GenTable")
私は私が望むハードコードを取得しません。
getAnywhere("GenTable")
「紳士」に一致する単一のオブジェクトが見つかりました
次の場所で見つかりました
package:topGO namespace:topGO
価値で
function (object, ...) standardGeneric("GenTable") <environment: 0x16a30c10> attr(,"generic") [1] "GenTable" attr(,"generic")attr(,"package") [1] "topGO" attr(,"package") [1] "topGO" attr(,"group") list() attr(,"valueClass") character(0) attr(,"signature") [1] "object" attr(,"default") `NULL` attr(,"skeleton") function (object, ...) stop("invalid call in method dispatch to \"GenTable\" (no default method)", domain = NA)(object, ...) attr(,"class") [1] "standardGeneric" attr(,"class")attr(,"package") [1] "methods"
これどうやってするの?
正しい解決策はありません
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