近親交配係数 / ライトアルゴリズム / 遺伝学

Question

SQL Server データベースに保存されている羊用の家系図データベースにライト アルゴリズムを実装するための優れた疑似コード、または実際のコード スニペットを探しています。

私は非常に古い C プログラムを持っていますが、母集団が大きくなりすぎてアルゴリズムが壊れるまでフラット テキスト ファイルに対して動作していました。すべての処理がメモリ内で行われていたため、データベースに対する実装が望ましいでしょう...

このようなものを見た人はいますか?教えてください。

Answer 1

自分でロールしたくない場合は、Python を使用できます。 パイペダルパッケージ のために 近親交配係数の計算, 、 どれの SQLデータベースをサポートします.

近親交配係数を計算するための Pypedal のコードは次のとおりです。 ここ.