DOT/GraphVizを使用した家系図のレイアウト
https://stackoverflow.com/questions/2271704
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20-09-2019 - |
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私はドットとグラフヴィズで家系図を描画しようとしています。
これは私が現在持っているものです：
# just graph set-up
digraph simpsons {
ratio = "auto"
mincross = 2.0
# draw some nodes
"Abraham" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Mona" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Clancy" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Jackeline" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Herb" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Homer" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Marge" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Patty" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Selma" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Bart" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Lisa" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Maggie" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Ling" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
# creating tiny nodes w/ no label, no color
"ParentsHomer" [shape=diamond,style=filled,label="",height=.1,width=.1] ;
"ParentsMarge" [shape=diamond,style=filled,label="",height=.1,width=.1] ;
"ParentsBart" [shape=diamond,style=filled,label="",height=.1,width=.1] ;
# draw the edges
"Abraham" -> "ParentsHomer" [dir=none, weight=1] ;
"Mona" -> "ParentsHomer" [dir=none, weight=1] ;
"ParentsHomer" -> "Homer" [dir=none, weight=2] ;
"ParentsHomer" -> "Herb" [dir=none, weight=2] ;
"Clancy" -> "ParentsMarge" [dir=none, weight=1] ;
"Jackeline" -> "ParentsMarge" [dir=none, weight=1] ;
"ParentsMarge" -> "Marge" [dir=none, weight=2] ;
"ParentsMarge" -> "Patty" [dir=none, weight=2] ;
"ParentsMarge" -> "Selma" [dir=none, weight=2] ;
"Homer" -> "ParentsBart" [dir=none, weight=1] ;
"Marge" -> "ParentsBart" [dir=none, weight=1] ;
"ParentsBart" -> "Bart" [dir=none, weight=2] ;
"ParentsBart" -> "Lisa" [dir=none, weight=2] ;
"ParentsBart" -> "Maggie" [dir=none, weight=2] ;
"Selma" -> "Ling" [dir=none, weight=2] ;
}
これをドットで実行した場合（dot simpsons.dot -Tsvg > simpsons.svg）、次のレイアウトが取得されます。
ただし、エッジがより「家系図」に似ていることを望みます。Tの垂直線を持つ2人の既婚者の間のT-ジャンクションは、それぞれの小さな下位区分を備えた逆さまのTジャンションで再び分岐します。このモックアップのように、子どもたちはkolourpaintで行われました：
これを達成するために使用しなければならないドット構文は何ですか？
解決
他の解決策は次のとおりです。
digraph simpsons {
subgraph Generation0 {
rank = same
Abraham [shape = box, color = blue]
Mona [shape = box, color = pink]
AbrahamAndMona [shape = point]
Abraham -> AbrahamAndMona [dir = none]
AbrahamAndMona -> Mona [dir = none]
Clancy [shape = box, color = blue]
Jackeline [shape = box, color = pink]
ClancyAndJackeline [shape = point]
Clancy -> ClancyAndJackeline [dir = none]
ClancyAndJackeline -> Jackeline [dir = none]
}
subgraph Generation0Sons {
rank = same
AbrahamAndMonaSons [shape = point]
HerbSon [shape = point]
HomerSon [shape = point]
HerbSon -> AbrahamAndMonaSons [dir = none]
HomerSon -> AbrahamAndMonaSons [dir = none]
MargeSon [shape = point]
PattySon [shape = point]
SelmaSon [shape = point]
MargeSon -> PattySon [dir = none]
PattySon -> SelmaSon [dir = none]
}
AbrahamAndMona -> AbrahamAndMonaSons [dir = none]
ClancyAndJackeline -> PattySon [dir = none]
subgraph Generation1 {
rank = same
Herb [shape = box, color = blue]
Homer [shape = box, color = blue]
Marge [shape = box, color = pink]
Patty [shape = box, color = pink]
Selma [shape = box, color = pink]
HomerAndMarge [shape = point]
Homer -> HomerAndMarge [dir = none]
Marge -> HomerAndMarge [dir = none]
}
HerbSon -> Herb [dir = none]
HomerSon -> Homer [dir = none]
MargeSon -> Marge [dir = none]
PattySon -> Patty [dir = none]
SelmaSon -> Selma [dir = none]
subgraph Generation1Sons {
rank = same
BartSon [shape = point]
LisaSon [shape = point]
MaggieSon [shape = point]
BartSon -> LisaSon [dir = none]
LisaSon -> MaggieSon [dir = none]
}
HomerAndMarge -> LisaSon [dir = none]
subgraph Generation2 {
rank = same
Bart [shape = box, color = blue]
Lisa [shape = box, color = pink]
Maggie [shape = box, color = pink]
Ling [shape = box, color = blue]
}
Selma -> Ling [dir = none]
BartSon -> Bart [dir = none]
LisaSon -> Lisa [dir = none]
MaggieSon -> Maggie [dir = none]
}
そして結果：
他のヒント
Gramps（www.gramps-project.org）は、結婚ノードの有無にかかわらず、家系図のドットファイルを生成します。 Grampsインターフェイス自体にこれを見る方法もあります。 http://gramps-project.org/wiki/index.php?title=graph_viewだから、グランプによって作成されたあなたの家系図の出力を見てください
任意の家系図を採取して、GraphVizで常によく見えるドットファイルを自動生成できるとは思いません。
しかし、私はあなたがいると思います できる あなたがいれば常に見栄えを良くします：
- ランクを使用して、OPが望む「T」接続を取得するために言及された同じ他の回答
- 奇妙な線を防ぐためにブライアン・ブランクがした注文のトリックを使用してください
- 二度目の結婚や半兄弟はないと仮定します
- 次のルールに従うツリーのサブセットのみを描画します。
- Sを「中央」の人とします
- sに兄弟がいる場合は、Sがすべての兄弟の正しいことを確認してください。
- Sが配偶者を持っていて、配偶者に兄弟がいる場合は、配偶者が兄弟全員の左側にあることを確認してください。
- ne、nie、叔母、叔父、SやSの配偶者を見せないでください
- 兄弟の配偶者を見せないでください
- 配偶者の兄弟の配偶者に見せないでください
- 子供をSの子供たちに見せますが、彼らの配偶者や子供ではありません
- 配偶者の親と親の両親を見せます
これは、中国のSで、一度に3世代以下を一度に表示することになります。
下の写真s = Homer（Brian Blankのバージョンからわずかに変更）：
digraph G {
edge [dir=none];
node [shape=box];
graph [splines=ortho];
"Herb" [shape=box, regular=0, color="blue", style="filled" fillcolor="lightblue"] ;
"Homer" [shape=box, regular=0, color="blue", style="bold, filled" fillcolor="lightblue"] ;
"Marge" [shape=oval, regular=0, color="red", style="filled" fillcolor="pink"] ;
"Clancy" [shape=box, regular=0, color="blue", style="filled" fillcolor="lightblue"] ;
"Jackeline" [shape=oval, regular=0, color="red", style="filled" fillcolor="pink"] ;
"Abraham" [shape=box, regular=0, color="blue", style="filled" fillcolor="lightblue"] ;
"Mona" [shape=oval, regular=0, color="red", style="filled" fillcolor="pink"] ;
"Patty" [shape=oval, regular=0, color="red", style="filled" fillcolor="pink"] ;
"Selma" [shape=oval, regular=0, color="red", style="filled" fillcolor="pink"] ;
"Bart" [shape=box, regular=0, color="blue", style="filled" fillcolor="lightblue"] ;
"Lisa" [shape=oval, regular=0, color="red", style="filled" fillcolor="pink"] ;
"Maggie" [shape=oval, regular=0, color="red", style="filled" fillcolor="pink"] ;
a1 [shape=diamond,label="",height=0.25,width=0.25];
b1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
b2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
b3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
{rank=same; Abraham -> a1 -> Mona};
{rank=same; b1 -> b2 -> b3};
{rank=same; Herb; Homer};
a1 -> b2
b1 -> Herb
b3 -> Homer
p1 [shape=diamond,label="",height=0.25,width=0.25];
q1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
q2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
q3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
{rank=same; Homer -> p1 -> Marge};
{rank=same; q1 -> q2 -> q3};
{rank=same; Bart; Lisa; Maggie};
p1 -> q2;
q1 -> Bart;
q2 -> Lisa;
q3 -> Maggie;
x1 [shape=diamond,label="",height=0.25,width=0.25];
y1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
y2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
y3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
{rank=same; Clancy -> x1 -> Jackeline};
{rank=same; y1 -> y2 -> y3};
{rank=same; Patty; Selma; Marge};
x1 -> y2;
y1 -> Marge;
y2 -> Patty;
y3 -> Selma;
}
これにより、Graphvizによって次のツリーが得られます（注釈付きの注釈付きで、Power Pointを追加しました）：
ノード配置を制御することはできませんが、ノードを別の順序で注文することでノード配置を支援できることがわかりました。以下に示すようにノードのいくつかを再注文し、クロスオーバーを生成しなかったグラフを取得しました。
次のコード：
digraph G {
edge [dir=none];
node [shape=box];
"Herb" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Homer" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Marge" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Clancy" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Jackeline" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Abraham" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Mona" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Patty" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Selma" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Bart" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Lisa" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Maggie" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Ling" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
a1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
b1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
b2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
b3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
{rank=same; Abraham -> a1 -> Mona};
{rank=same; b1 -> b2 -> b3};
{rank=same; Herb; Homer};
a1 -> b2
b1 -> Herb
b3 -> Homer
p1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
q1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
q2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
q3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
{rank=same; Homer -> p1 -> Marge};
{rank=same; q1 -> q2 -> q3};
{rank=same; Bart; Lisa; Maggie};
p1 -> q2;
q1 -> Bart;
q2 -> Lisa;
q3 -> Maggie;
x1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
y1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
y2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
y3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
{rank=same; Clancy -> x1 -> Jackeline};
{rank=same; y1 -> y2 -> y3};
{rank=same; Marge; Patty; Selma};
{rank=same; Bart; Ling}
x1 -> y2;
y1 -> Marge;
y2 -> Patty;
y3 -> Selma;
Selma -> Ling;
}
今これを生成します：
なぜそれが機能しているのか完全にはわかりませんが、ここに私が行った変更の思考プロセスがあります。
- アブラハム/モナが彼らが間違った側にいると考えて前に、私はクランシー/ジャケットラインを置いた。これは写真を変えましたが、それでも完璧ではありませんでした。
- ホーマー/マージは、ソフトウェアがこれらのピースを最初に考慮し、ホーマー/マージに比べて他のすべてのノードを配置する必要があると考えて最初に考えました。これはさらに役立ちましたが、それでも完璧ではありませんでした。
- ハーブはまだ誤った配置だったので、グラフヴィズが最初にハーブの配置を検討するように、私は最初にハーブを置いた。
うまくいきましたが、エッジが重複しない一貫した木を確保するアルゴリズムを考案することはできません。 Graphvizはこれらのヒントなしでより良い仕事をするべきだと思います。使用されているアルゴリズムはわかりませんが、オーバーラップエッジを最小限に抑えるか排除するための目的関数を考慮すると、より良いアルゴリズムを考案することができるはずです。
GraphVizでこれを行うことはかなり簡単です。必要な構文パターンがいくつかあります。（i）ライン間接続を表す構文（上記のプロットの「t」 - 機能）。 （ii）階層構造を強制する構文（すなわち、垂直軸上の同じ平面上の同じ生成のノード）。表示する方が簡単です：
digraph G {
nodesep=0.6;
edge [arrowsize=0.3];
"g1" -> "g2" -> "g3" -> "g4"
{ rank = same;
"g1"; "King"; "ph1"; "Queen";
};
{ rank = same;
"g2"; "ph2"; "ph2L"; "ph2R"; "ph2LL"; "ph2RR"
};
{ rank = same;
"g3"; "ps1"; "ps2"; "pr1"; "pr2"
};
"King" -> "ph1" [arrowsize=0.0];
"ph1" -> "Queen" [arrowsize=0.0];
"ph1" -> "ph2" [arrowsize=0.0];
"ph2LL" -> "ph2L" [arrowsize=0.0];
"ph2L" -> "ph2" [arrowsize=0.0];
"ph2" -> "ph2R" [arrowsize=0.0];
"ph2R" -> "ph2RR" [arrowsize=0.0];
"ph2LL" -> "ps1" [arrowsize=0.0];
"ph2L"-> "pr1" [arrowsize=0.0];
"ph2R" -> "ps2" [arrowsize=0.0];
"ph2RR" -> "pr2" [arrowsize=0.0];
}
上記のコードは、以下のグラフを作成します（ノードの色付けに使用したコードを省略しました）。左側（g1-> g2 ....）の「ガイド」をvislbleに残して、同じランクのノード間の位置をどのように施行したかを示すだけで、おそらく自分のプロットでは見えないようにしたいと思うでしょう。最後に、「pH」で始まるラベルのあるノードは、「t-ジャニカショション」のプレースホルダーノードです。
私はほとんどそこにいて、触発されています GraphViz-Interest Mailinglistの古い応答 と ダグの答え.
次のコード：
digraph G {
edge [dir=none];
node [shape=box];
"Abraham" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Mona" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Clancy" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Jackeline" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Herb" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Homer" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Marge" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Patty" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Selma" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Bart" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Lisa" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Maggie" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Ling" [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
a1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
b1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
b2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
b3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
{rank=same; Abraham -> a1 -> Mona};
{rank=same; b1 -> b2 -> b3};
{rank=same; Herb; Homer};
a1 -> b2
b1 -> Herb
b3 -> Homer
p1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
q1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
q2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
q3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
{rank=same; Homer -> p1 -> Marge};
{rank=same; q1 -> q2 -> q3};
{rank=same; Bart; Lisa; Maggie};
p1 -> q2;
q1 -> Bart;
q2 -> Lisa;
q3 -> Maggie;
x1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
y1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
y2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
y3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
{rank=same; Clancy -> x1 -> Jackeline};
{rank=same; y1 -> y2 -> y3};
{rank=same; Marge; Patty; Selma};
{rank=same; Bart; Ling}
x1 -> y2;
y1 -> Marge;
y2 -> Patty;
y3 -> Selma;
Selma -> Ling;
}
今これを生成します：
だから、ホーマーの周りの奇妙な端を除いてよさそうだ。アブラハム、モナ、ハーブを写真の左側に移動する方法を見つけることができれば、完全に揃った絵があるだろう。
それを達成する方法についてのアイデアはありますか？
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