Layout de árvore genealógica com ponto/graphviz

Question

Estou tentando desenhar uma árvore genealógica com pontos e graphviz.

Isso é o que eu tenho atualmente:

# just graph set-up
digraph simpsons {
ratio = "auto"
mincross = 2.0

# draw some nodes
"Abraham"   [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Mona"      [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Clancy"    [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Jackeline" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Herb"      [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Homer"     [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Marge"     [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Patty"     [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Selma"     [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Bart"      [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
"Lisa"      [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Maggie"    [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
"Ling"      [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
# creating tiny nodes w/ no label, no color
"ParentsHomer" [shape=diamond,style=filled,label="",height=.1,width=.1] ;
"ParentsMarge" [shape=diamond,style=filled,label="",height=.1,width=.1] ;
"ParentsBart"  [shape=diamond,style=filled,label="",height=.1,width=.1] ;

# draw the edges
"Abraham"      -> "ParentsHomer" [dir=none, weight=1] ;
"Mona"         -> "ParentsHomer" [dir=none, weight=1] ;
"ParentsHomer" -> "Homer"        [dir=none, weight=2] ;
"ParentsHomer" -> "Herb"         [dir=none, weight=2] ;
"Clancy"       -> "ParentsMarge" [dir=none, weight=1] ;
"Jackeline"    -> "ParentsMarge" [dir=none, weight=1] ;
"ParentsMarge" -> "Marge"        [dir=none, weight=2] ;
"ParentsMarge" -> "Patty"        [dir=none, weight=2] ;
"ParentsMarge" -> "Selma"        [dir=none, weight=2] ;
"Homer"        -> "ParentsBart"  [dir=none, weight=1] ;
"Marge"        -> "ParentsBart"  [dir=none, weight=1] ;
"ParentsBart"  -> "Bart"         [dir=none, weight=2] ;
"ParentsBart"  -> "Lisa"         [dir=none, weight=2] ;
"ParentsBart"  -> "Maggie"       [dir=none, weight=2] ;
"Selma"        -> "Ling"         [dir=none, weight=2] ;
}

Se eu executar isso através do DOT (dot simpsons.dot -Tsvg > simpsons.svg), Recebo o seguinte layout:

No entanto, eu gostaria que as bordas fossem mais "árvores genealógicas": uma junção T entre duas pessoas casadas com a linha vertical do T novamente se ramificando em uma junção T de cabeça para baixo com pequenas subdivisões para cada um dos Crianças, como esta maquete, feitas em Kolourpaint:

Qual é a sintaxe do ponto que eu tenho que usar para conseguir isso?

Answer 1

Aqui está uma outra solução:

digraph simpsons {  
  subgraph Generation0 {
    rank = same
    Abraham [shape = box, color = blue]
    Mona [shape = box, color = pink]
    AbrahamAndMona [shape = point]
    Abraham -> AbrahamAndMona [dir = none]
    AbrahamAndMona -> Mona [dir = none]

    Clancy [shape = box, color = blue]
    Jackeline [shape = box, color = pink]
    ClancyAndJackeline [shape = point]
    Clancy -> ClancyAndJackeline [dir = none]
    ClancyAndJackeline -> Jackeline [dir = none]
  }

  subgraph Generation0Sons {
    rank = same
    AbrahamAndMonaSons [shape = point]
    HerbSon [shape = point]
    HomerSon [shape = point]
    HerbSon -> AbrahamAndMonaSons [dir = none]
    HomerSon -> AbrahamAndMonaSons [dir = none]

    MargeSon [shape = point]
    PattySon [shape = point]
    SelmaSon [shape = point]
    MargeSon -> PattySon [dir = none] 
    PattySon -> SelmaSon [dir = none] 
  }

  AbrahamAndMona -> AbrahamAndMonaSons [dir = none]
  ClancyAndJackeline -> PattySon [dir = none]

  subgraph Generation1 {
    rank  =  same
    Herb [shape = box, color = blue] 
    Homer [shape = box, color = blue] 
    Marge [shape = box, color = pink] 
    Patty [shape = box, color = pink] 
    Selma [shape = box, color = pink] 

    HomerAndMarge [shape = point]
    Homer -> HomerAndMarge [dir = none]
    Marge -> HomerAndMarge [dir = none]
  }

  HerbSon -> Herb [dir = none]
  HomerSon -> Homer [dir = none]
  MargeSon -> Marge [dir = none]
  PattySon -> Patty [dir = none]
  SelmaSon -> Selma [dir = none]

  subgraph Generation1Sons {
    rank  =  same
    BartSon [shape = point] 
    LisaSon [shape = point] 
    MaggieSon [shape = point] 

    BartSon -> LisaSon [dir = none]
    LisaSon -> MaggieSon [dir = none]
  }

  HomerAndMarge -> LisaSon [dir = none]

  subgraph Generation2 {
    rank  =  same
    Bart [shape = box, color = blue] 
    Lisa [shape = box, color = pink] 
    Maggie [shape = box, color = pink] 
    Ling [shape = box, color = blue] 
  }

  Selma -> Ling [dir = none]
  BartSon -> Bart [dir = none]
  LisaSon -> Lisa [dir = none]
  MaggieSon -> Maggie [dir = none]
}

E o resultado :

Answer 2

Gramps (www.glamps-project.org) gera arquivos de pontos para árvores familiares, com ou sem nós de casamento. Há também uma maneira de ver isso na própria interface do Gramps. http://glamps-project.org/wiki/index.php?title=graph_viewEntão eu diria: olhe para a saída de sua árvore genealógica criada por GRAMPS

Answer 3

Eu não acho que você possa pegar uma árvore genealógica arbitrária e um arquivo de pontuação automática, onde sempre fica bem no GraphViz.

Mas eu acho que você posso Sempre faça parecer bom se você:

• Use a classificação = as mesmas outras respostas mencionadas para obter as conexões 'T' desejadas pelo OP
• Use o truque de pedido que Brian Blank fez para evitar linhas estranhas
• Assume nenhum segundo casamento e meio-irmãos
• Desenhe apenas um subconjunto da árvore que obedece às seguintes regras:
  • Seja s ser a pessoa "centro"
  • Se S tiver irmãos, certifique -se de que S esteja bem de todos eles.
  • Se S tiver um cônjuge e o cônjuge tiver irmãos, verifique se o cônjuge está à esquerda de todos os seus irmãos.
  • Não mostre sobrinhos, sobrinhas, tias ou tios do cônjuge de S ou S
  • Não mostre cônjuges de irmãos
  • Não mostre cônjuges dos irmãos do cônjuge
  • Mostrar filhos de s, mas não seus cônjuges ou filhos
  • Mostrar pais de s e pais de cônjuge

Isso acabará mostrando não mais de 3 gerações de uma só vez, com S na geração média.

Na figura abaixo S = Homer (ligeiramente modificada da versão de Brian Blank):

digraph G {
  edge [dir=none];
  node [shape=box];
  graph [splines=ortho];

  "Herb"      [shape=box, regular=0, color="blue", style="filled" fillcolor="lightblue"] ;
  "Homer"     [shape=box, regular=0, color="blue", style="bold, filled" fillcolor="lightblue"] ;
  "Marge"     [shape=oval, regular=0, color="red", style="filled" fillcolor="pink"] ;
  "Clancy"    [shape=box, regular=0, color="blue", style="filled" fillcolor="lightblue"] ;
  "Jackeline" [shape=oval, regular=0, color="red", style="filled" fillcolor="pink"] ;
  "Abraham"   [shape=box, regular=0, color="blue", style="filled" fillcolor="lightblue"] ;
  "Mona"      [shape=oval, regular=0, color="red", style="filled" fillcolor="pink"] ;
  "Patty"     [shape=oval, regular=0, color="red", style="filled" fillcolor="pink"] ;
  "Selma"     [shape=oval, regular=0, color="red", style="filled" fillcolor="pink"] ;
  "Bart"      [shape=box, regular=0, color="blue", style="filled" fillcolor="lightblue"] ;
  "Lisa"      [shape=oval, regular=0, color="red", style="filled" fillcolor="pink"] ;
  "Maggie"    [shape=oval, regular=0, color="red", style="filled" fillcolor="pink"] ;

  a1 [shape=diamond,label="",height=0.25,width=0.25];
  b1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  b2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  b3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  {rank=same; Abraham -> a1 -> Mona};
  {rank=same; b1 -> b2 -> b3};
  {rank=same; Herb; Homer};
  a1 -> b2
  b1 -> Herb
  b3 -> Homer

  p1 [shape=diamond,label="",height=0.25,width=0.25];
  q1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  q2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  q3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  {rank=same; Homer -> p1 -> Marge};
  {rank=same; q1 -> q2 -> q3};
  {rank=same; Bart; Lisa; Maggie};
  p1 -> q2;
  q1 -> Bart;
  q2 -> Lisa;
  q3 -> Maggie;

  x1 [shape=diamond,label="",height=0.25,width=0.25];
  y1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  y2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  y3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  {rank=same; Clancy -> x1 -> Jackeline};
  {rank=same; y1 -> y2 -> y3};
  {rank=same; Patty; Selma; Marge};
  x1 -> y2;
  y1 -> Marge;
  y2 -> Patty;
  y3 -> Selma;
}

Isso produz a seguinte árvore por GraphViz (com anotações que adicionei com Power Point):

Answer 4

Embora você não possa controlar o posicionamento do nó, descobri que você pode ajudar a colocação do nó, solicitando os nós em uma ordem diferente. Recomendei alguns dos nós, como mostrado abaixo, e recebi um gráfico que não produzia cruzamentos.

O seguinte código:

digraph G {
  edge [dir=none];
  node [shape=box];

  "Herb"      [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
  "Homer"     [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
  "Marge"     [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
  "Clancy"    [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
  "Jackeline" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
  "Abraham"   [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
  "Mona"      [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
  "Patty"     [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
  "Selma"     [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
  "Bart"      [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
  "Lisa"      [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
  "Maggie"    [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
  "Ling"      [shape=box, regular=1, color="blue"] ;

  a1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  b1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  b2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  b3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  {rank=same; Abraham -> a1 -> Mona};
  {rank=same; b1 -> b2 -> b3};
  {rank=same; Herb; Homer};
  a1 -> b2
  b1 -> Herb
  b3 -> Homer

  p1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  q1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  q2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  q3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  {rank=same; Homer -> p1 -> Marge};
  {rank=same; q1 -> q2 -> q3};
  {rank=same; Bart; Lisa; Maggie};
  p1 -> q2;
  q1 -> Bart;
  q2 -> Lisa;
  q3 -> Maggie;

  x1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  y1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  y2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  y3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  {rank=same; Clancy -> x1 -> Jackeline};
  {rank=same; y1 -> y2 -> y3};
  {rank=same; Marge; Patty; Selma};
  {rank=same; Bart; Ling}
  x1 -> y2;
  y1 -> Marge;
  y2 -> Patty;
  y3 -> Selma;
  Selma -> Ling;
}

agora produz isso:

Não entendo completamente por que está funcionando, mas aqui está o processo de pensamento nas mudanças que fiz.

1. Coloquei Clancy/Jackine antes de Abraham/Mona pensando que eles estavam do lado errado. Isso mudou a imagem, mas ainda não era perfeita.
2. Coloquei Homer/Marge primeiro pensando que o software tinha que considerar essas peças primeiro e talvez colocar todos os outros nós em relação a Homer/Marge. Isso ajudou ainda mais, mas ainda não era perfeito.
3. Herb ainda estava mal colocado, então coloquei Herb primeiro para que o GraphViz pudesse considerar a colocação da erva primeiro.

Funcionou, mas ainda não consigo criar um algoritmo que garanta árvores consistentes sem bordas sobrepostas. Eu sinto que o GraphViz deve fazer um trabalho melhor sem essas dicas. Não sei o algoritmo usado, mas se eles consideram uma função objetiva para minimizar ou eliminar as bordas sobrepostas, deve ser possível criar um algoritmo melhor.

Answer 5

Fazer isso no GraphViz é bastante direto; Existem alguns padrões de sintaxe que você precisa: (i) sintaxe para representar a conexão de linha a linha (a junção "t" em suas parcelas acima); (ii) Sintaxe para aplicar a estrutura hierárquica (isto é, nós da mesma geração no mesmo plano no eixo vertical). É mais fácil mostrar:

digraph G {
    nodesep=0.6;
    edge [arrowsize=0.3];

    "g1" -> "g2" -> "g3" -> "g4"

    { rank = same;
        "g1"; "King"; "ph1"; "Queen";
    };

    { rank = same; 
        "g2"; "ph2"; "ph2L"; "ph2R"; "ph2LL"; "ph2RR"
    };

    { rank = same;
        "g3"; "ps1"; "ps2"; "pr1"; "pr2"
    };

    "King" -> "ph1" [arrowsize=0.0];
    "ph1" -> "Queen" [arrowsize=0.0];

    "ph1" -> "ph2" [arrowsize=0.0];
    "ph2LL" -> "ph2L" [arrowsize=0.0];
    "ph2L" -> "ph2" [arrowsize=0.0];
    "ph2" -> "ph2R" [arrowsize=0.0];
    "ph2R" -> "ph2RR" [arrowsize=0.0];

    "ph2LL" -> "ps1" [arrowsize=0.0];
    "ph2L"-> "pr1" [arrowsize=0.0];
    "ph2R" -> "ps2" [arrowsize=0.0];
    "ph2RR" -> "pr2" [arrowsize=0.0];

}

O código acima produzirá o gráfico abaixo (omiti o código que usei para colorir os nós). Deixei vislble o "Guia" à esquerda (G1-> G2 ....) apenas para mostrar como apliquei as posições entre nós de classificação igual, você provavelmente desejará torná-lo invisível em suas próprias parcelas. Finalmente, os nós com os rótulos que começam com 'ph' são os nós da área reservada para as "junções t".

Answer 6

Estou quase lá, inspirado por Uma resposta antiga na lista de Maininglist e A resposta de Doug.

O seguinte código:

digraph G {
  edge [dir=none];
  node [shape=box];

  "Abraham"   [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
  "Mona"      [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
  "Clancy"    [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
  "Jackeline" [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
  "Herb"      [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
  "Homer"     [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
  "Marge"     [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
  "Patty"     [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
  "Selma"     [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
  "Bart"      [shape=box, regular=1, color="blue"] ;
  "Lisa"      [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
  "Maggie"    [shape=box, regular=1, color="pink"] ;
  "Ling"      [shape=box, regular=1, color="blue"] ;

  a1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  b1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  b2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  b3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  {rank=same; Abraham -> a1 -> Mona};
  {rank=same; b1 -> b2 -> b3};
  {rank=same; Herb; Homer};
  a1 -> b2
  b1 -> Herb
  b3 -> Homer

  p1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  q1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  q2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  q3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  {rank=same; Homer -> p1 -> Marge};
  {rank=same; q1 -> q2 -> q3};
  {rank=same; Bart; Lisa; Maggie};
  p1 -> q2;
  q1 -> Bart;
  q2 -> Lisa;
  q3 -> Maggie;

  x1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  y1 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  y2 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  y3 [shape=circle,label="",height=0.01,width=0.01];
  {rank=same; Clancy -> x1 -> Jackeline};
  {rank=same; y1 -> y2 -> y3};
  {rank=same; Marge; Patty; Selma};
  {rank=same; Bart; Ling}
  x1 -> y2;
  y1 -> Marge;
  y2 -> Patty;
  y3 -> Selma;
  Selma -> Ling;
}

agora produz isso:

Então, parece bom, exceto por aquela vantagem estranha em torno de Homer. Se eu pudesse encontrar uma maneira de mover Abraão, Mona e Herb para o lado esquerdo da imagem, eu teria uma imagem perfeitamente alinhada.

Alguma idéia de como conseguir isso?