Respondendo à minha própria pergunta:
O bug ocorreu nos ambientes de hibernação com 3.6 que, em alguns casos, tiveram problemas com nomes de pacotes derivados de nomes de domínio da Estônia (por exemplo, ee.codeto.foo).Isso aconteceu devido ao fato de que os ambientes de hibernação em algum momento durante a construção da consulta usaram "ee" como alias e no caso de nomes completos de classes com pacotes serem usados (agora sempre), então o hibernate pensou que a próxima parte do nome do pacote após "ee "é um nome de coluna.
Nas versões posteriores do hibernate, esse problema foi resolvido.Provavelmente não por causa de nomes de domínio da Estônia, mas devido ao melhor uso de alias."ee_" é usado em vez de "ee".Portanto, quando você tiver o azar de ter um pacote com "ee_" como a primeira parte do nome do pacote e usa hibernate envers e usa mapeamento muitos-para-muitos e tem o infeliz caso de o hibernet tentar usar nomes completos de classes com pacotes, então há uma chance muito pequena que você pode ser infligido por esse bug.