不明なドライバの種類 "MPIO"

Question

誰もが私を解決策/理解のために私を導くことができるかどうか感謝します：

f = h5py.File(filename, 'w', driver='mpio', comm=comm)
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/h5py/_hl/files.py", line 149, in __init__
fapl = make_fapl(driver,libver,**kwds)
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/h5py/_hl/files.py", line 37, in make_fapl
raise ValueError('Unknown driver type "%s"' % driver)
ValueError: Unknown driver type "mpio"

.

Ubuntuソフトウェアセンターを使用してH5PYをインストールしました。（h5cc -showconfigを走行し、並列HDF5が有効になっていることに注意してください。）

コア2デュオを搭載したMacBook Airで実行されています。これは、Ubuntu 13.04の仮想デスクトップに対して1つのコアを有効にします。

Answer 1

Ubuntuに付属のH5Pyのバージョンは、ではなく並列HDF5に対して構築されていました。そのため、MPIドライバを使用することはできません。あなたは手でh5pyを構築する必要があります。最も便利な方法はVirtualenv環境を使用することです。そのため、並列H5PyバージョンはUbuntuインストール版バージョンに干渉しません。あなたがしなければならないのは：

1. H5Py.org
からH5Pyのソースコードを解凍します。
2. グローバルにH5PYをインストールする必要がある場合は、VirtualEnvにあることを確認してください。ただし、UbuntuでH5Pyをアンインストールすることができません）
3. $ export cc= mpicc
4. $ python setup.py build --mpi
5. $ python setup.py

それはそれです。 http://docs.h5py.org/en/latest/mpi.html 詳細は