Вам не нужно импортировать другой ресурс в каждом модуле. Попробуйте вместо этого использовать строку в качестве аргумента.
class StudentResource(ModelResource):
course = fields.ForeignKey('website.api.course.CourseResource', "course")
class CourseResource(ModelResource):
student = fields.ForeignKey('website.api.student.StudentResource', "student")