Wie installiert man Tophat in Debian?

Question

Ich habe versucht, alles zu suchen und alles zu versuchen.Ich habe Bowtie, Samtools und Libbam-dev in meinem System installiert.Während des Ausführens generakodicetagcode erhalte ich diesen Fehler: generasacodicetagpre.

Wie löse ich diesen Fehler und installieren Sie tophat?

Answer 1

Samtools muss protarisch verpackt sein, andernfalls kann tophat sie nicht benutzen.Also:

.
1. baum BAM aus der Quelle zuerst bauen.Holen Sie sich bei http://samtools.sourceforge.net/ .
2. Wählen Sie den BAM-Installationsordner (ich bezeichne es als install unten).
3. Kopieren Sie alle C-Header-Dateien auf install / include / bam .
4. kopieren libbam.a auf install / lib .
5. Ort samtools binär auf Ihrem Weg.
6. für tophat, versuchen Sie ./ konfigurieren --with-bam= install
7. Wenn dies nicht aus seltsamen Grund funktioniert, exportieren Sie auch Bam_Root= install , bevor Sie ./ Konfigurieren .