Debería poder usar PowerShell para Azure para lograr lo que necesita.
Aquí hay un ejemplo de cómo crear una base de datos:http://blogs.msdn.com/b/windowsazure/archive/2013/02/07/windows-azure-sql-database-management-with-powershell.aspx
Aquí hay un ejemplo de PowerShell de la creación de usuarios de SQL:http://sqldbawithabeard.com/2013/09/23/add-user-to-database-role-with-powershell/