Comment installer des haut-de-forme dans Debian?

Question

J'ai essayé de chercher et d'essayer tout ce qui.J'ai papillon, samtools et libbam-dev installé dans mon système.Lors de l'exécution ./configure J'obtiens cette erreur:

checking for bamlib... configure: error: We could not detect the
bam libraries (version  or higher). If you have a staged bam library
(still not installed) please specify $BAM_ROOT in your environment
and do not give a PATH to --with-bam option.

Comment puis-je résoudre cette erreur et d'installer des haut-de-forme?

Answer 1

SAMtools doit être proparly emballés, sinon haut-de-forme ne peut pas les utiliser.Donc:

1. Construire BAM à partir de la source première.L'obtenir à http://samtools.sourceforge.net/.
2. Choisissez la BAM dossier d'installation (je me réfère à elle comme installer ci-dessous).
3. Copier tous les fichiers d'en-tête C à installer/inclure/bam.
4. Copie libbam.un pour installer/lib.
5. Place samtools binaire sur votre chemin.
6. Pour le haut-de-forme, essayez de ./configurer --with-bam=installer
7. Si cela ne fonctionne pas pour une raison étrange, essayez également d'exportation BAM_ROOT=installer avant d'exécuter ./configurer.